About: Mnohaúrovňová analýza funkce signálních lipidů a jejich vazebných proteinů v regulaci vrcholového růstu rostlinné buňky

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Mnohaúrovňová analýza funkce signálních lipidů a jejich vazebných proteinů v regulaci vrcholového růstu rostlinné buňky Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-19073S
Description	Minor membrane lipids such as phosphatidic acid (PA), diacylglycerol (DAG) and phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PIP2) control cell polarity and vesicular trafficking in non-plant cells. In this project we will investigate the role of plant PA and DAG in cooperation with PIP2 as localization cues, which recruit their effector proteins to the specific membranes or membrane domains. We will employ highly polarized tip-growing pollen tubes as a plant unicellular model system. We will identify novel PA, DAG and PIP2-effector proteins and by combining diverse experimental and computational approaches we will characterize lipid-protein interplay involved in cell polarity. In parallel, we will perform structure-function study of lipid targeting for selected subunits of exocyst, vesicle tethering complex that we described in plants. Given unique lipid levels in plant membranes, we will study possible synergistic role of PA, DAG and PIP2 and their microdomain organization in lipid bilayer by utilizing advance microscopic techniques and state of the art molecular dynamics simulations. (en) Minoritní membránové fosfolipidy jako kyselina fosfatidová (PA), diacylglycerol (DAG) a fosfatidylinositol 4,5-difosfát (PIP2) regulují buněčnou polaritu a váčkový transport u kvasinek a živočišných buněk. V tomto projektu budeme zkoumat roli PA a DAG v koordinaci s PIP2 jako lokalizačních podnětů, které cílí efektorové proteiny na specifické membrány nebo membránové domény. Jako jednobuněčný modelový rostlinný systém s výhodou využijeme vrcholově rostoucí pylové láčky tabáku. Budeme hledat nové PA, DAG a PIP2 efektorové proteiny a kombinací experimentálních a výpočetních přístupů budeme charakterizovat jejich vzájemnou funkční interakci v buněčné polaritě. Souběžně se zaměříme na strukturně-funkční studie vazby lipidů s podjednotkami proteinového komplexu exocyst, jehož funkci ve váčkovém transportu rostlin jsme popsali. Vzhledem k jedinečnému poměru hladin lipidů v rostlinných membránách budeme studovat možnou kooperativitu PA, DAG a PIP2 a jejich mikrodoménovou organizaci v lipidové dvojvrstvě s využitím pokročilých mikroskopických technik a molekulárně dynamických simulací.
Title	Mnohaúrovňová analýza funkce signálních lipidů a jejich vazebných proteinů v regulaci vrcholového růstu rostlinné buňky Multiscale analysis of signalling phospholipids and their interaction protein partners in the regulation of plant tip growth (en)
skos:notation	GA13-19073S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-19073S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-19073S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100770238
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	cell polarity, computational structural biology, exocyst, molecular dynamics, phospholipids, plant signalling, pollen tube, secretory pathway, tip growth (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-19073S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	BO - Biofyzika CE - Biochemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	cell polarity computational structural biology exocyst molecular dynamics phospholipids plant signalling pollen tube secretory pathway
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Live-cell imaging of phosphatidic acid dynamics in pollen tubes visualized by Spo20p-derived biosensor Regulation of cytoskeletal dynamics by phospholipase D and phosphatidic acid Antisense Oligodeoxynucleotide-Mediated Gene Knockdown in Pollen Tubes When fat is not bad: the regulation of actin dynamics by phospholipid signaling molecules
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-19073S/2013/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-19073S/2014/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-19073S/2015/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-19073S/2016/ico%3A61389030

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 18 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software