About: Insights into protein structure from polarization fluorescence microscopy

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Insights into protein structure from polarization fluorescence microscopy Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-10799S
Description	Optical properties of fluorescent proteins (FPs) are anisotropic. This fact can be used to develop a broad range of genetically encoded probes of biological processes. In principle, FP anisotropy (through polarization microscopy) can also provide information about protein structure, in living cells. This possibility, however, remains unexplored. We want to fill this gap by testing the hypothesis that polarization microscopy can be used to determine the orientation of an FP with respect to other parts of a fusion protein. In order to achieve this goal, we will: 1) determine orientation of transition dipole moments (TDMs) with respect to the cell membrane in FP-labeled membrane proteins; 2) determine TDM direction in molecules of representative FPs; and 3) determine orientation of the FP moiety in several membrane protein constructs and compare the results with available structural data. The results will provide fundamental information about FPs, allow improvements in genetically encoded fluorescent probes, and yield new tools for obtaining protein structure information. (en) Optické vlastnosti fluorescentních proteinů (FP) jsou anisotropické, čehož lze využít při vývoji a použití řady geneticky kódovaných fluorescentních sond biologických procesů. Anisotropie FP však také může (prostřednictvím polarizační mikroskopie) poskytovat informace o struktuře proteinů, přímo v živých buňkách. Tato možnost je však v současnosti neprozkoumána. Navrhujeme proto tuto mezeru zaplnit otestováním hypotézy, že polarizační mikroskopii lze využít k určení orientace FP vůči jiným částem fúzního proteinu. Abychom toho dosáhli, tak 1) určíme orientaci dipólových momentů přechodu (DMP) vůči buněčné membráně u membránových proteinů značených pomocí FP; 2) určíme směr DMP v molekulách významných FP; 3) určíme orientaci FP v konstruktech na bázi membránových proteinů a porovnáme ji s dostupnými strukturními daty. Naše výsledky poskytnou základní informace o fluorescentních proteinech, umožní zlepšení současných geneticky kódovaných fluorescentních sond, a přispějí k vývoji nových nástrojů pro získávání strukturních informací o proteinech.
Title	Insights into protein structure from polarization fluorescence microscopy (en) Výzkum struktury proteinů prostřednictvím polarizační fluorescenční mikroskopie
skos:notation	GA13-10799S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-10799S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-10799S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100770076
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	BO - Biofyzika
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	fluorescent protein, linear dichroism, transition dipole moment, polarization microscopy, membrane protein structure, FRET (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Centrum výzkumu globální změny AV ČR v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-10799S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie ED - Fyziologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	linear dichroism membrane protein structure polarization microscopy transition dipole moment fluorescent protein
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Accurate Determination of the Orientational Distribution of a Fluorescent Molecule in a Phospholipid Membrane
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-10799S/2013/ico%3A67179843 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-10799S/2014/ico%3A67179843 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-10799S/2015/ico%3A67179843 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-10799S/2016/ico%3A67179843

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 67 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software