About: Struktura, exprese a evoluce genů pro ribosomální RNA u rostlin: novými přistupy k řešení starých otázek

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Struktura, exprese a evoluce genů pro ribosomální RNA u rostlin: novými přistupy k řešení starých otázek Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-10057S
Description	Polyplodie sehrává významnou úlohu v evoluci cévnatých rostlin včetně hospodářsky významných plodin. V kombinaci s mezidruhovou hybridizací (alopolyploidie) může vest ke vzniku nových biologických druhů s odlišnými fenotypy a adaptačními schopnostmi. Navzdory pokroku v porozumění funkce a evoluce polyploidního genomu, mnoho zásadních otázek zůstává nejasných, z nichž některé se pokusíme zodpovědět v navrhovaném projektu. Předmětem výzkumu budou geny pro ribosomální RNA (rDNA), které jsou esenciálními složkami všech buněk, a které byly v minulosti předmětem mnoha evolučních a cytogenetických studií. Cílem projektu je studovat jejich chromosomální a jednotkovou organizaci a expresi v procesu alopolyplodie. Genetická a epigenetická plasticita rDNA bude analyzována metodami klasické molekulární biologie a genomickými přístupy včetně sekvenačních metod nové generace. Předmětem výzkumu budou jak hospodářské plodiny tak i přírodní populace invasivních alopolyploidních druhů. Konečně bude periodicky aktualizována a analyzována veřejně přístupná elektronická databáze rostlinných lokusů rDNA. (en) Most, if not all, wild and cultivated plants are polyploids and have undergone at least one, and usually several cycles of genome duplication during the course of their evolution. Despite significant progress in our understanding of polyploid genomes many aspects of their evolution remain poorly understood. For over decades, the rRNA genes (rDNA) have been the most popular target region in the nuclear genome for evolutionary studies of diverse plant groups. We aim to determine the chromosome and unit organization and expression of rDNA in several groups of higher plants, particularly in a sample representing the allopolyploid (combination of interspecific hybridization with genome multiplication) species of recent origin. Using genomic, population genetics, and next-generation sequencing approaches we will assess the genetic and epigenetic plasticity of rDNA units. The objects of research will include both crop and natural populations of invasive species. The recently developed on-line database of rDNA loci will be continuously updated and analyzed.
Title	Struktura, exprese a evoluce genů pro ribosomální RNA u rostlin: novými přistupy k řešení starých otázek Structure, expression and evolution of ribosomal RNA genes in plant genomes: new approaches to old questions (en)
skos:notation	GA13-10057S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-10057S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-10057S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100770032
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	polyploidy, evolution, genome, chromosome, rDNA, mutation, homogenization, selection, next generation sequencing (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	8 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	8 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-19 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-10057S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	polyploidy chromosome evolution genome homogenization mutation rDNA selection
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Endogenous pararetrovirus sequences associated with 24 nt small RNAs at the centromeres of Fritillaria imperialis L. (Liliaceae), a species with a giant genome High Penetrance of a Pan-Canina Type rDNA Family in Intersection Rosa Hybrids Suggests Strong Selection of Bivalent Chromosomes in the Section Caninae Dancing together and separate again: gymnosperms exhibit frequent changes of fundamental 5S and 35S rRNA gene (rDNA) organisation Epigenetic switches of tobacco transgenes associate with transient redistribution of histone marks in callus culture Diploidization and genome size change in allopolyploids is associated with differential dynamics of low- and high-copy sequences Evaluation of DNA bending models in their capacity to predict electrophoretic migration anomalies of satellite DNA sequences The More the Merrier: Recent Hybridization and Polyploidy in Cardamine How to interpret Methylation Sensitive Amplified Polymorphism (MSAP) profiles?
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-10057S/2013/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-10057S/2014/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-10057S/2015/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-10057S/2016/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 46 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software