About: The role of epigenetic processes in DNA repair

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The role of epigenetic processes in DNA repair Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=GA13-07822S
Description	Every day, genomes are insulted by genetoxic stress that causes DNA damage. Disorders in DNA composition initiate DNA repair machinery leading to healing of damaged chromatin. During evolution, multiple DNA damage repair mechanisms were developed. Thus, we decided to study DNA damage responses (DDRs) in different cell types, including histone methyltransferases SUV39h double null (dn) and H2AX (dn) fibroblasts. These cells will be exposed to different experimental stimuli, including inhibitors of histone acetyltransferases (HATs) and histone deacetylases (HDACs) and then DNA damage will be induced. We will study recruitment of epigenetically important proteins, such as HP1 (HP1 beta, ΔCD HP1beta, and ΔCSD HP1beta) and BMI1, to UV-induced DNA lesions. Moreover, interaction between proteins of interest will be tested by FRET technique. An immense effort will be directed towards analysis of γH2AX and 53BP1 status in spontaneously occurring DNA lesions of entire genome and in compartment of nucleoli. Results of our experiments should imply which epigenetic events play a role in DDRs. (en) Každým dnem je genom vystavován genotoxickému stresu, který způsobuje poškození DNA. Poškození DNA iniciuje DNA reparační procesy, které vedou k obnově intaktního řetězce DNA. Z tohoto důvodu jsme se rozhodli studovat odpovědi genomu na poškození DNA u různých buněčných typů, včetně fibroblastů s vyblokovanou funkcí SUV39h histonových metyltransferáz a histonu H2AX. Vybrané buněčné typy budou vystaveny působení různých experimentálních stimulů, které indukují změny v histonovém kódu. Zaměříme se na působení inhibitorů histonových acetyltransferáz (HATs) a histonových deacetyláz (HDACs) na procesy reparace DNA. Dále jsme se rozhodli studovat funkci epigeneticky významných proteinů, jako je HP1 (HP1 beta, ΔCD HP1beta, and ΔCSD HP1beta) a BMI1, v oblastech s indukovanými DNA lézemi. Interakce mezi vybranými proteiny budou testovány metodou FRET. Snaha bude rovněž koncentrována na analýzu profilu γH2AX a 53BP1 ve spontánně se vyskytujících DNA lézích a v kompartmentu jadérek. Výsledky experimentů by měly naznačit, jaké epigenetické procesy probíhají během reparace DNA.
Title	The role of epigenetic processes in DNA repair (en) Úloha epigenetických procesů při reparaci DNA
skos:notation	GA13-07822S
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Standard projects
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-07822S/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/GA13-07822S/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-04-23 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100769887
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Chromatin, DNA repair, histones, epigenetics, microscopy (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Biofyzikální ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2014-03-31 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/13-07822S
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2015
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2015
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SGA0201300005
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVB
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2016-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBB
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Chromatin DNA repair epigenetics histones
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	DNA-damage response in chromatin of ribosomal genes and the surrounding genome Cell differentiation along multiple pathways accompanied by changes in histone acetylation status Recruitment of HP1 beta to UVA-induced DNA lesions is independent of radiation-induced changes in A-type lamins Coilin is rapidly recruited to UVA-induced DNA lesions and gamma-radiation affects localized movement of Cajal bodies Basic nuclear processes affected by histone acetyltransferases and histone deacetylase inhibitors HP1 beta-dependent recruitment of UBF1 to irradiated chromatin occurs simultaneously with CPDs
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-07822S/2013/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-07822S/2014/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-07822S/2015/ico%3A68081707 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/GA13-07822S/2016/ico%3A68081707

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 46 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software