About: Population and molecular-genetic studies of progressive retinal atrophies (PRA) in dog breeds bred in Czech Republic

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Population and molecular-genetic studies of progressive retinal atrophies (PRA) in dog breeds bred in Czech Republic - methods of their detection Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=1QS500450578
Description	To elaborate molecular genetic methods for practical testing of hereditary retinal atrophy (PRA) in different dog breeds. The aim of the project is to determine homozygotes for the disease and heterozygotes - carriers of the disease, correct breeding plans in cooperation with breeders clubs to decrease disease frequency in purebred breeds in our country. Eight mutations controlling the disease development in different dog breeds have already been described. Some methods of practical testing are unfortunately patented. One of the mutation causing the disease in briards and beagles is deletion of 4 base pairs in exon 5 of RPE65 gene. Fragment of this reagion has already been amplified and sequenced in our lab. PCR fragments were succesfully tested for polymorphism by electrophoresis in agarose gel for practical use. A similar approach will be used for some other mutations in candidate genes usion some other methods as well (DGGE, SSCP). (en) Rozpracovat molekulárně genetické metody pro praktické testování hereditární atrofie sítnice (PRA) u různých plemen psů. Cílem projektu je poznat jedince homozygotní ještě před rozvojem choroby a heterozygoty - nositele vlohy, upravit připařovací plány a ve spolupráci s chovatelskými kluby snížit výskyt defektu u čistokrevných plemen psů chovaných u nás. V současné době je popsáno 8 příčinných mutací kontrolujících vývoj choroby. Metody praktického využití jsou však patentovány. Jednou z příčinných mutací, která kontroluje vývoj choroby u briardů a bíglů je delece 4 bází v exonu 5, genu RPE65. Fragment tohoto úseku genu byl v naší laboratoři amplifikován a sekvenován. Elekroforézou v agarozovém gelu byl pozorován polymorfismus PCR fragmentů, což je metoda pro praktické testování této mutace. Podobně bude postupováno u dalších mutací využitím i dalších metod (DGGE, SSCP, aj.).
Title	Population and molecular-genetic studies of progressive retinal atrophies (PRA) in dog breeds bred in Czech Republic - methods of their detection (en) Populační a molekulárně genetická studia progresivní retinální atrofie (PRA) u plemen psů chovaných v ČR - metody analýz a prevence
skos:notation	1QS500450578
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The supprot of targeted research projects (National proramme of research)
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/1QS500450578/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/1QS500450578/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2009-07-02 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	69355915
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	NV - Aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového výzkumu (tzv. %22neprůmyslový výzkum%22)
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	frequences; dog; molecular genetic methods; hereditary retinal atrophy; PRA; DNA analysis; primers; amplification; sequences (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2008-02-21 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/1QS500450578
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2008
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2009
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02005-CI
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2008-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2005-07-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Causative mutations for inherited blindness (CSNB, CEA, PRCD, rcd 1a, cord 1) were studied in 22 populations of purebred dogs. In cooperation with breeders clubs breeding management was consulted and studies of other mutations and modifiers were started. (en) Byly studovány příčinné mutace dědičné slepoty (CSNB, CEA, PRCD, rcd 1a, cord 1) v populacích 22 čistokrevných plemen psů. Ve spolupráci s chovatelskými kluby byly konzultovány úpravy připařovacích plánů, studium dalších mutací a modifikačních genů. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	DNA analysis dog PRA amplification hereditary retinal atrophy molecular genetic methods primers frequences
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Analysis of genetic variability in the Czech Dachshund population using microsatellite markers Simplified PCR analysis of mutation in the NHEJ1 gene causing Collie eye anomaly in some dog breeds Mutation in the RPE65 gene causing hereditary retinal dystrophy in the Briard dogs: application of a new detection method The retinal fascin gene 2 (FSCN2) - partial structural analysis and polymorphisms detection in dogs with progressive retinal atrophy (PRA)
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1QS500450578/2007/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1QS500450578/2008/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1QS500450578/2009/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1QS500450578/2005/ico%3A67985904 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1QS500450578/2006/ico%3A67985904

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software