About: Functional Characterization of Bacterial Proton-Dependent Manganese Transporters (MntH) using Fluorescence Methods

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Functional Characterization of Bacterial Proton-Dependent Manganese Transporters (MntH) using Fluorescence Methods Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=1K04019
Description	Since the Nramp family of divalent metal ion transporters contributes to host resistance, it appears that functional bacterial homologs of Nramp (MntH) inherited by horizontal gene transfer may be important for pathogenesis. The proposed project aims at further development and optimisation of sensitive fluorescence techniques allowing to study the transport by proton-dependent manganese transporters (MntH) in living bacteria. We will study the changes of intracellular concentration of proton and of metal substrate resulting from MntH-dependent transport using pH-sensitive ratiometric Green Fluorescent Protein and a metal sensitive fluorescent probe, respectively. These fluorescence assays will be used to investigate the potential binding sites in bacterial MntH transporters, to probe the possible evolution of Nramp family and to challenge functional differences between phylogenetic groups of MntH. (en) Jelikož rodina transportérů dvojmocných kovových iontů Nramp přispívá k rezistenci hostitele, zdá se, že funkční bakteriální homology Nramp (MntH) získané horizontálním genovým přenosem mohou být důležité v procesu patogeneze. Hlavním cílem předkládaného projektu je další vývoj a optimalizace citlivých fluorescenčních technik umožňujících studium transportu transportéry manganu závislými na protonovém gradientu (MntH) v živých bakteriích. Budeme studovat změny intracelulární koncentrace protonů a kovového substrátu vyvolané funkcí MntH transportérů pomocí zeleného fluorescenčního proteinu (GFP) citlivého na pH resp. vhodné fluorescenční sondy citlivé na přítomnost daného kovu. Tyto fluorescenční techniky budou použity ke studiu potenciálních vazebných míst v bakteriálních MntH transportérech, ke zkoumání možných evolučních změn rodiny proteinů Nramp a porovnání fylogenetických skupin MntH transportérů z hlediska jejich funkce.
Title	Functional Characterization of Bacterial Proton-Dependent Manganese Transporters (MntH) using Fluorescence Methods (en) Funkční charakterizace bakteriálních transportérů manganu závislých na protonovém gradientu (MntH) pomocí fluorescenčních metod
skos:notation	1K04019
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Promotion and support of young research workers (National programme of research)
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/1K04019/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/1K04019/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-06-25 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	2683399
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	BO - Biofyzika
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	IF - Infrastruktura výzkumu a vývoje
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	ratiometric GFP; intracellular pH; bacteria; divalent metal ion; MntH transporter; Nramp transporter; fluorescent probe; secondary metal transporter; E. coli (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Matematicko-fyzikální fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2006
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2004
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2007
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMSM2003001K1
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EC - Imunologie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Projekt přinesl řadu nových poznatků v problematice membránových transportérů. Byla zřízena nová laboratoř a získání grantu GA ČR svědčí o pokračování výzkumu v této problematice. (cs) The project made up a series of new knowledge in diaphragm transporters problematic. It was established a new laboratory and successful application for GA ČR grant shows that research in this branch will continue. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	bacteria intracellular pH MntH transporter Nramp transporter divalent metal ion fluorescent probe secondary metal transporter ratiometric GFP
is http://linked.open...vavai/riv/projekt of	Recent progress in structure-function analyses of Nramp proton-dependent metal-ion transporters. Functional properties of a prototypical member of the NRAMP superfamily of metal-ion transporters.
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1K04019/2007/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1K04019/2004/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1K04019/2005/orjk%3A11320 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/1K04019/2006/orjk%3A11320

Faceted Search & Find service v1.16.116 as of Feb 22 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3239 as of Feb 22 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 67 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software