The aim of the project is pharmacogenomic analysis of the severe toxicity development following fluoropyrimidines treatment, focused on catabolic enzymes of their metabolism DPD and DPYS. A clinical utilization of the analysis will be evaluated. Using molecular biology approaches we will perform analysis of a) mutation in DPYD/DPYS b) their expression c) DPYD promoter in population of patients treated by fluoropyrimidines w/wo toxicity. Population frequency of mutations will be performed. Mutations will be studied by DHPLC/sequencing. Novel mutations will be characterized by computer modeling of protein structure. Expression will be quantified by real-time PCR. Promoter sequences will be studied by methylation-specific PCR/sequencing. Statistical analysis of results and their correlation with clinical data allows assessment of: reduction of morbidity and mortality, treatment efficacy in patients w/wo pharmacogenomic analysis and evaluation of inpatient and treatment costs. (en)
Cílem projektu je farmakogenomická analýza vzniku závažné toxicity po aplikaci fluoropyrimidinů, zaměřená na katabolické enzymy jejich metabolismu - dihydropyrimidindehydrogenázu (DPD) a dihydropyrimidinázu (DPYS), a možnosti její klinické aplikace. Pomocí metod molekulární biologie provedeme u pacientů s/bez výskytu závažné toxicity a) mutační analýzy DPYD/DPYS b) analýzu jejich exprese, c) analýzu promotoru DPYD. Určení frekvence mutací bude provedeno na vzorcích neselektované populace Mutační analýza bude provedena kombinací DHPLC/sekvenování. Nové mutace budou studovány pomocí molekulárního modelování. Exprese bude kvantifikována real-time RT-PCR. Promotorové sekvence budou studovány pomocí metyl specifického PCR/sekvenování. Po statistické analýze výsledků bude vyhodnoceno: zkrácení doby hospitalizace, morbidity a mortality, účinnosti terapie u pacientů léčených fluoropyrimidiny s/bez farmakogenomické analýzy předcházející léčbu.
ANALYSIS OF GENETIC AND EPIGENETIC EVENTS RESPONSIBLE FOR DEVELOPMENT OF SEVERE AND LETHAL TOXICITY FOLLOWING FLUOROPYRIMIDINES TREATMENT IN ONCOLOGY PATIENTS (en)
Analýza genetických a epigenetických faktorů vedoucích k rozvoji projevů závažné až letální toxicity léčby fluoropyrimidiny u onkologických pacientů
The result of the project are new biological and clinical information that solves issues related toxicity of cancer treatment and specification of genetic and epigenetic factors of the patient (en)
Výsledkem projektu jsou nové biologické a klinické informace, které řeší problematiku vztahu toxicity nádorové léčby a specifikace genetických a epigenetických faktorů pacienta. (cs)