An isolate of ASPV (apple stem pitting virus) will be obtained from IPO-DLO, Wageningen. The isolate will be inoculated and maintained in the indicator plants. RT-PCR will be optimised for the detection of ASPV. Screening of the occurrence of ASPV will be performed in several selected intensive apple and pear orchards in the Czech Republic. According to detailed study, it will be completed a complex method for the detection of ASPV. A PCR technique for the detection of Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus (Cmi) in alfalfa tissue will be elaborated. Alfalfa plants will be infected with Cmi. The occurence of Cmi will be tested in seeds, stems and roots respectively of infected plants. A procedure for isolating populations of sporangiaof the causal agent of potatoe wart disease Synchytrium endobioticum from potatoe wart tissue will be devised. After that a PCR based assay for the identification of S. endobioticum races will be developed. The method for the detection of grapevine ne (en)
Standardní izolát ASPV (virus vrásčitosti kmene jabloně) bude získán z IPO-DLO ve Wageningenu. Tento izolát bude inokulován a udržován na indikátorových rostlinách. Bude optimalizována metoda RT-PCR pro detekci ASPV a proveden průzkum rozšíření ASPV ve vybraných intenzivních sadech jabloní a hrušní na území ČR. Na základě podrobné studie bude vyhotovena komplexní metodika diagnostiky ASPV. Bude vypracována metodika detekce Clavibacter michiganensis subsp. insidiosus (Cmi) založená na PCR v semenech a rostlinách vojtěšky. Rostliny vojtěšky budou infikovány Cmi a semena sklizená z těchto rostlin budou testována na přítomnost Cmi. Bude optimalizován postup izolace sporangií původce rakoviny brambor Synchytrium endobioticum z nádorů vyvolaných tímto patogenem. Bude vyvinut protokol identifikace jednotlivých ras S. endobioticum využívající PCR. Bude optimalizována metoda detekce nepovirů infikujících révu vinnou (virus roncetu révy vinné - grapevine fanleaf virus GFLV, virus mozaiky huseníku - (cs)