About: Development of a method for prediction of pathological expansions of trinucleotide repeats in the human genome     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Na základě našich předběžných výsledků navrhujeme testovat hypotézu, že patologické prodlužování mikrosatelitů v lidském genomu lze simulovat běžnou PCR in vitro. Tuto hypotézu nudeme testovat kombinací PCR a bioinformatiky. Provedeme PCR asi 1000 fragmentů DNA délky 10-60 nukleotidů, které se nacházejí v patologicky se prodlužujících oblastech lidského genomu a výsledky zobecníme do pravidel přiřazujícíh libovolné posloupnosti nukleotidů náchylnost k prodlužování. Provedeme bioinformatickou analýzui nukleotidových posloupností lidského genomu. Zjistíme, zda frekvence výskytu a délka mikrosatelitů v lidském genomu koreluje s jejich prodlužováním při PCR in vitro. Získané výsledky zobecníme do pravidel přiřazujících náchylnost k prodlužování fragmentům v lidském genomu. Pro pochopení mechanismu prodlužování podrobíme vybrané fragmenty DNA biofyzikální analýze. (cs)
  • We propose to test a hypothesis following from our preliminary results that the common PCR in vitro simulates the pathological microsatellite expansions in the human genome. We will use PCr and human genome bioinformatics for purpose. Perform PCR in vitro of about 1000 DNA fragments 10-60 nucleotides in lenght occuring pathologically expanding human genome regions. Generalize the results into rules precting propensity to the expansion to the nucleotide sequence. Carry out a bioinformatic analysis of the human genome. Find whether the microsatellite frequency of occurrence and lenght correlates with the expansion during PCR in vitro. Generalize the results of the project into rules assigning propensity to expansion to the fragments in the human genome. Analyze selected DNA fragments by biophysical methods to understand the mechanism of expansion. (en)
Title
  • Development of a method for prediction of pathological expansions of trinucleotide repeats in the human genome (en)
  • Vývoj metody pro predikci patologického prodlužování trinukleotidových opakování v lidském genomu (cs)
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • genome;human;expansion;pathological;PCR;bioinformatics;biophysics;DNA (en)
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 89 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software