About: The use of metagenomics and metatranscriptomics for identification of active microorganisms and microbial processes

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: The use of metagenomics and metatranscriptomics for identification of active microorganisms and microbial processes Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Projekt je zaměřen na identifikaci aktivních členů mikrobiálních společenstev půdy, na základě analýzy rRNA a mRNA transkriptů metodami next-generation-sequencing. Budou vyvinuty protokoly pro reproducibilní práci s environmentálními metatranskriptomy, zejména pro eukaryotní mikroorganismy. Údaje o taxonomickém složení společenstev a o abundanci jednotlivých taxonů budou kombinovány s anotací sekvencí z transkriptomů, aby bylo možné identifikovat podíl jednotlivých skupin mikroorganismů na environmentálních procesech. Kombinace genomových sekvencí s transkriptomikou za definovaných podmínek a specifická identifikace druhově-specifických sekvencí v metatranskriptomech přispěje k objasnění autekologie vybraných mikroorganismů. Projekt bude rovněž zahrnovat systematický průzkum vybraných půd z hlediska biogeografie mikroorganismů na celoevropské úrovni. (cs) The project aims to identify the active microbial community represented by the RNA pool and transcriptionally active in the environment using next-generation-sequencing. The main challenge of the project is the development of protocols that will allow reproducible and reliable work with environmental metatranscriptomes, especially the eukaryotic ones. The information on the taxonomic composition of communities and the abundance of individual taxa will be combined with the assignment of transcriptome-derived sequences to analyse the contribution of individual groups of organisms to the processes in the environment. The combination of genome sequences of selected microbial taxa and model strains with transcriptomics under defined conditions and the specific search for the species-specific sequences will contribute to the understanding of the autecology of individual microbes. The project will also comprise systematic survey of important microbial habitats within a European framework. (en)
Title	The use of metagenomics and metatranscriptomics for identification of active microorganisms and microbial processes (en) Kombinace přístupů metatranskriptomiky a metagenomiky pro identifikaci aktivních mikroorganismů a jejich funkce v půdě (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/MSMT-7027/2012-36
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/54635780
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EH
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EE
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/LD
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SMSM2012LD2
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	ecology; next-generation-sequencing; biodiversity; metagenomics; metatranscriptomics; soil ecology (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2015-06-30 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/MSM
http://linked.open...avai/start-reseni	2012-03-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	1666 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	1666 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	0 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2012/LD12048/ico-61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2013/LD12048/ico-61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2014/LD12048/ico-61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2015/LD12048/ico-61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 39 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software