About: Effect of protein hydration shell on the stability of protein complexes

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Effect of protein hydration shell on the stability of protein complexes Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Interakce protein-protein jsou základem většiny buněčných procesů. Vodné prostředí, ve kterém se tyto procesy odehrávají, není pasivním médiem, ale hraje aktivní roli v určování struktury a dynamiky jak proteinů, tak jejich komplexů. Přesné molekulární podrobnosti příspěvku vody k vazbě protein-protein však stále ještě nejsou dostatečně známy. V tomto projektu proto navrhujeme využít nejnovějšího vývoje na poli molekulárně dynamických modelů vody a šíře informací obsažených v obrovském množství rentgenových krystalových struktur proteinových komplexů k objasnění této otázky. Navrhujeme prozkoumat souvislost mezi vlastnostmi povrchu obou proteinových monomerů účastnících se interakce, chováním vody na povrchu proteinů a strukturou a afinitou výsledného protein-proteinového komplexu. Získané poznatky budou užitečné v inženýrství nových umělých vazebných proteinů s aplikacemi např. jako biofarmaceutika v lidské medicíně. (cs) Protein-protein interactions are at the basis of almost all cellular processes. The water environment, in which these processes take place, is not a passive medium, but plays an active part in determining the structure and dynamics of both proteins and protein complexes. However, the exact molecular details of water contribution to protein-protein binding are not yet fully understood. Here we propose to take advantage of the latest developments in molecular dynamics models of water and of the wealth of information contained in the large number of X-ray crystal structures of protein complexes to elucidate this question. We propose to investigate the connection between surface properties of both protein monomers taking part in the interaction, water molecule behavior at the protein surface, and the structure and affinity of the resulting protein-protein complex. The insight thus gained will be useful in engineering new artificial binding proteins with applications e.g. as biopharmaceuticals in human medicine. (en)
Title	Vliv hydratačního obalu proteinů na stabilitu proteinových komplexů (cs) Effect of protein hydration shell on the stability of protein complexes (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/P205/12/P729
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/54476504
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/CF
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/GP
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SGA02011GA1PD
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	protein-protein interaction; protein complex; protein hydration dynamics; molecular dynamics; molecular (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/GA0
http://linked.open...avai/start-reseni	2012-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	2520 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	2520 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	0 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2012/GPP205/12/P729/ico-86652036 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2013/GPP205/12/P729/ico-86652036 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2014/GPP205/12/P729/ico-86652036

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software