About: Analýza diversity metabolicky aktivních bakterií v kontaminované zemině s využitím isotopového značení a metagenomiky

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Analýza diversity metabolicky aktivních bakterií v kontaminované zemině s využitím isotopového značení a metagenomiky Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Accurate assessment of microbial diversity and activity and their responses to different stimuli is one of the central goals of microbial ecology. This project aims to employ DNA-stable isotope probing (SIP) and metagenomics to extensively study microbial communities and their functional genes in polychlorinated biphenyl (PCB)-contaminated soil. The overall aim is to discover how shifts in microbial community structure (upon the presence of halophytic plant species, excess of salt, and bioaugmentation) correlate with changes in metabolic activity and hence the removal of PCBs from the soil. In addition to phylogenetic diversity, functional diversity will be analyzed of the genes encoding for dioxygenases involved in the biodegradation of biphenyl and PCBs. The planned experimental design also has an advantage that it will monitor the diversity and abundance of these dioxygenases in response to contamination of a pristine soil. This will help further relate the primary structure of these enzymes with the affinity towards PCBs. (en) Přesné posouzení mikrobiální diversity a aktivity a jejích reakcí na působení různých faktorů je jedním z hlavních úkolů mikrobiální ekologie. V rámci předkládaného projektu budou pomocí metod isotopového značení DNA a metagenomiky studovány mikrobiální komunity a jejich funkční geny v zemině kontaminované polychlorovanými bifenyly (PCB). Hlavním cílem je popsat, jak změny ve struktuře mikrobiálních komunit (v přítomnosti halofytních rostlin, v přebytku soli a po bioaugmentaci) korelují s metabolickou aktivitou a potažmo s odbouráváním PCB ze zeminy. Vedle diversity fylogenetické bude analyzována i funkční diversita dioxygenas, které se podílejí na metabolismu bifenylu a PCB. Experiment umožňuje též sledovat vývoj diversity těchto dioxygenas bezprostředně po kontaminaci zeminy PCB za účelem lepšího porozumění vtahům mezi primární strukturou a substrátovou specificitou těchto enzymů. (cs)
Title	Analýza diversity metabolicky aktivních bakterií v kontaminované zemině s využitím isotopového značení a metagenomiky (en) Analýza diversity metabolicky aktivních bakterií v kontaminované zemině s využitím isotopového značení a metagenomiky (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/13-20414P
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/DK
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/54474501
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EE
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EH
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/GP
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SGA0201300002
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	microbial; diversity; metabolic; activity; bioremediation; stable; isotope; probing; metagenomics (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2015-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/GA0
http://linked.open...avai/start-reseni	2013-02-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	1996 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	1996 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	0 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2013/GP13-20414P/orjk-22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2014/GP13-20414P/orjk-22330 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2015/GP13-20414P/orjk-22330

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software