Většina kardiovaskulárních fenotypů jsou kvantitativní znaky determinované genetickými faktory a faktory prostředí. V předkládaném projektu budeme analyzovat genetické determinanty klinicky důležitých kardiovaskulárních fenotypů u rekombinantních inbredních (RI) kmenů, odvozených od spontánně hypertenzních potkanů kmene SHR a normotenzních potkanů kmene Brown Norway (BXH/HXB RI kmeny), pomocí integrace vazebných analýz s analýzou profilů genové exprese. BXH/HXB panel RI kmenů představuje unikátnímodelový systém pro tyto studie. V tomto projektu odhalíme lokusy kvantitativních znaků (QTL) regulujících hmotnost myokardu, periinfarktové arytmie a velikost infarktu myokardu. Pomocí analýzy Affymetrix cDNA čipů určíme expresi genů v levé komoře srdeční u RI kmenů a u progenitorů. Expresní QTL (eQTL; genetické determinanty asociované s expresí genů), které budou lokalizovány blízko (+10Mb) genů samotných (cis-regulované eQTL) a blízko fyziologických QTL, budou vybrány jako kandidátní geny pro (cs)
Many cardiovascular (CV) phenotypes are quantitative traits determined by genetic and environmental factors. This project will characterize the genetic determinants of clinically important CV phenotypes in recombinant inbred (RI) rats derived from the Spontaneously Hypertensive and normotensive Brown Norway rats (BXH/HXB RI panel) using an integrated linkage and expression profiling approach. The BXH/HXB panel is uniquely suited for these studies, which relates to parental differences in CV phenotypes. In this project we will identify quantitative trait loci (QTLs) that regulate cardiac mass, peri-infarct arrhythmias and infarct size. Global cardiac gene expression will be determined using Affymetrix microarrays across the BXH/HXB panel andin parental strains. Expression QTLs (eQTLs; gene expression that is heritable and maps to a discrete region of the genome), which map close (+10Mb) to their own genomic location (cis-acting eQTLs) and co-localize with physiological QTLs (pQTLs) will be (en)