Recently our laboratory attempted to identify cDNA sequences of plant DNA (cytosine-5) methyltransferase genes in Nicotiana sylvestris. Clones with partial sequences of METI, CMT and DRM genes coding for all three main subfamilies of plant (cytosine-5) methyltransferases were obtained. The main aim of the project is to clone and sequence complete mRNA coding for METI, CMT and DRM from N. sylvestris and data submit to public nucleotide databases. The expression in different developmental stages and tissues will be measured. The number of genes for each methyltransferase subfamily in N. sylvestris genome will be estimated and mRNA nucleotide sequence polymorphism will be studied. We will identify the gene transcripts in allotetraploid plant Nicotiana tabacum whether they are from maternal S genome, paternal T genome or both and whether they are altered by stress conditions. Selected regions of genes will be used for phylogenetic studies in genus Nicotiana in collaboration with Prof. A.R. (en)
Nedávno se naše laboratoř pokusila identifikovat cDNA sekvence rostlinných DNA-(cytosin-5)-methyltransferás u Nicotiana sylvestris. Byly získány klony s částečnými sekvencemi METI, CMT a DRM genů kódujících všechny tři hlavní podrodiny rostlinných DNA-(cytosin-5)-methyltransferás. Hlavní cíl projektu je klonovat a sekvenovat kompletní mRNA kódující METI, CMT a DRM u N. sylvestris a vložit data do veřejných nukleotidových databází. Bude měřena míra exprese v různých vývojových stádiích a pletivech.Bude odhadnut počet genů v každé podrodině methyltransferas v genomu N. sylvestris a bude studován sekvenční polymorfismus mRNA. Budou identifikovány transkripty methyltransferas u allotetraploidní rostliny Nicotiana tabacum, zda pochází z mateřského S genomu, otcovského T genomu nebo obou a zda jsou ovlivněny stresujícími podmínkami. Vybrané oblasti genů budou použity pro studium fylogeneze rodu Nicotiana ve spolupráci s laboratoří Prof. A.R. Leitch. Budou připraveny konstrukty pro transgenosu, které (cs)