About: Analysis of sequences and distribution of the selfish DNA in the genome of moths and butterflies (Lepidoptera).     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Genome size in moths and butterflies differs dramatically not only among distant species, but also in close relatives. This feature is general in eukaryotic organisms and is caused by different amounts of so called selfish DNA. The selfish DNAs are considered to be genome parasites, on the other hand they were repeatedly proved to play an important role in the evolution of their hosts. Moreover, they are necessary for proper function of some chromosomal structures. In spite of their importance and interest, the data on the selfish DNAs are underrepresented in Lepidoptera. Thus, we propose to isolate and characterize the selfish DNAs in selected lepidopteran species. We will gain more information on its sequences and distribution in the host chromosomes and presence in other species. The proposed techniques are: microdissection of the W chromosome, PCR amplification using TRAS1 primers, GSP-PCR, digestion of the genomic DNA via restriction nucleases, and Cot1 DNA cloning. (en)
  • Velikosti genomu u motýlů se dramaticky liší nejen u vzdálených druhů, ale i mezi blízkými příbuznými. Tento jev je možné pozorovat v různé míře i u ostatních eukaryotických organizmů a je způsoben odlišným množstvím tzv. sobecké DNA. Sobecké DNA, tedy mobilní elementy a satelitní DNA, jsou sice považovány za genomové parazity, na druhou stranu bylo opakovaně prokázáno, že hrají roli v evoluci svých hostitelů a jsou nezbytné pro fungování některých důležitých chromosomových struktur. Navzdory své důležitosti a zajímavosti ale není sobecká DNA u motýlů příliš prozkoumaná. Proto navrhujeme izolovat a charakterizovat sobeckou DNA z vybraných druhů motýlů, které nám umožní získat informace jak o konkrétních sekvencích nových mobilních elementů a satelitů, tak o jejich distribuci na chromosomech hostitele a výskytu u dalších druhů. Navrhované techniky izolace jsou mikrodisekce chromosomu W, PCR aplifikace pomocí TRAS1 primerů, GSP-PCR, restrikční štěpení genomové DNA a klonování Cot1 DNA. (cs)
Title
  • Analýza sekvencí a distribuce sobecké DNA v genomu motýlů (Lepidoptera). (cs)
  • Analysis of sequences and distribution of the selfish DNA in the genome of moths and butterflies (Lepidoptera). (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • selfish DNA; mobile elements; satellite DNA; Lepidoptera; W chromosome; TRAS (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...avai/start-reseni
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software