| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - Bananas and plantains (Musa spp.) are crops that have an enormous socio-economic importance. Edible banana cultivars are seed-sterile diploid, triploid and tetraploid clones. Despite the relatively small genome (1C = 550 – 650 Mbp), the structure and organization of nuclear genome and genetic diversity of Musa is still largely unknown. In this project, we will use ultra-high-throughput DNA sequencing technology (454 Sequencing, Roche). The current system, the genome sequencer FLX, generates about 100 million high quality bases in one run. During this project, we plan to perform one sequence run for M. acuminata and Ensete ventricosum. 454´s data will be used to study structure and organization of their nuclear genomes and for comparative analysis. 454´s data will provide insights useful for the assembly of the nucleotide sequence of the entire nuclear genome, as well as to study genetic diversity of genus Musa. (en)
- Banánovník (Musa sp.) je rostlina s velkým socioekonomickým významem. Pěstované formy banánovníku jsou náhodně vzniklé varianty jejichž původ není zcela jasný. Přestože jaderný genom banánovníku je relativně malý (1C = 550 – 650 Mbp), jeho struktura a organizace, stejně jako genetická variabilita zatím není známá. V rámci navrhovaného projektu bude využito masivně paralelního sekvenování – technologie 454 sekvenování (systém FLX, Roche), která generuje v jedné sekvenační reakci až 100 milionů bází s průměrnou délkou inzertů 200 bází. V průběhu projektu budou 454 technologií částečně sekvenovány (cca z 15%) druhy M. acuminata a Ensete ventricosum. Sekvenační data budou použita k analýze struktury jejich jaderných genomů a ke srovnávací analýze mezi těmito zástupci čeledi Musacea. Získané poznatky a sekvenační data přispějí k sestavení úplné nukleotidové sekvence jaderného genomu banánovníku a současně budou použity ke studiu diverzity u širšího spektra zástupců čeledi Musaceae. (cs)
|
| Title
| - Comparative genome analysis in banana (Musa spp.) using 454 sequencing (en)
- Srovnávací analýza genomu banánovníku (Musa spp.) pomocí 454 sekvenování (cs)
|
| http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
| |
| http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
| |
| http://linked.open...avai/druh-souteze
| |
| http://linked.open...domain/vavai/faze
| |
| http://linked.open...vavai/hlavni-obor
| |
| http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
| |
| http://linked.open...vavai/id-aktivity
| |
| http://linked.open.../vavai/id-souteze
| |
| http://linked.open...n/vavai/kategorie
| |
| http://linked.open...vai/klicova-slova
| - bananas; 454 pyrosequencing; repetitive DNA; comparative analysis (en)
|
| http://linked.open...avai/konec-reseni
| |
| http://linked.open...nujicich-prijemcu
| |
| http://linked.open...avai/poskytovatel
| |
| http://linked.open...avai/start-reseni
| |
| http://linked.open...ai/statni-podpora
| |
| http://linked.open...vavai/typProjektu
| |
| http://linked.open...ai/uznane-naklady
| |
| http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
| |
| http://linked.open...cet-spoluprijemcu
| |
| http://linked.open...ai/pocet-vysledku
| |
| http://linked.open...ku-zverejnovanych
| |
| is http://linked.open...ain/vavai/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)