About: Structural and functional determinants on TRPM5 and TRPM8 channels     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • The main aims of this proposal are to characterize the secondary structures of N- and C-intracellular termini of channels TRPM5 and TRPM8. Another part of the project will be the localization of the binding site(s) for calmodulin on both termini of TRPM5 and TRPM8 The series of different lengths of fusion proteins of both termini of both channels will be made to obtain sufficient amounts of soluble proteins. Another goal will be to localize the selectivity filter in the loop between TM5 and TM6 in TRPM5 and TRPM8, respectively. The role of the aminoacids residues in the lower part of alpha helix of TM6 in gating processes of TRPM5 and TRPM8 will be also followed. To confirm experimentally acquired data on native TRPM5, and TRPM8 and their mutant constructs the homology model of TRP channels will be created by dynamic molecular simulation based on KcsA bacterial channel template / or mammalian potassium Shaker channel. (en)
  • Cílem tohoto projektu je charakterizace sekundárních struktur N– a C– intracelulárních konců TRPM5 a TRPM8 kanálů pomocí různých spektroskopických metod jako je cirkulární dichroismus, fluorescenční a Ramanova spektroskopie. Dále určit vazebná místa pro kalmodulin na obou koncích těchto kanálů. Připravit řadu fúzních proteinů s různou délkou N- a C- konců obou kanálů. Lokalizovat selektivní filtr v kličce mezi pátou a šestou transmembránou doménou TRPM5 a TRPM8 kanálu. Dále zjistit úlohu jednotlivých aminokys. zbytků v dolní části alfa-helixu šesté transmembránové domény obou kanálů při procesu otevírání kanálů pomocí elektrofyziologických měření v přechodně transfekovaných HEK293 buňkách. Experimentálně získaná data na nativních a mutovaných na obou kanálech budou korelována s homologními modely vytvořenými na základě molekulárně dyn. simulace s krystalickými strukturami bakteriálního draslíkového kanálu KcsA nebo živočišného draslíkového kanálu Shaker K.v1.2 sloužících jako templát. (cs)
Title
  • Structural and functional determinants on TRPM5 and TRPM8 channels (en)
  • Strukturní a funkční determinanty na kanálech TRPM5 a TRPM8 (cs)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor
http://linked.open...avai/druh-souteze
http://linked.open...domain/vavai/faze
http://linked.open...vavai/hlavni-obor
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor
http://linked.open...vavai/id-aktivity
http://linked.open.../vavai/id-souteze
http://linked.open...n/vavai/kategorie
http://linked.open...vai/klicova-slova
  • TRPM channel; mutagenesis; expression of recombinant proteins; structure; electrophysiology; vibrational spectroscopy; fluorescence spectroscopy (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni
http://linked.open...nujicich-prijemcu
http://linked.open...avai/poskytovatel
http://linked.open...avai/start-reseni
http://linked.open...ai/statni-podpora
http://linked.open...vavai/typProjektu
http://linked.open...ai/uznane-naklady
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
http://linked.open...cet-spoluprijemcu
http://linked.open...ai/pocet-vysledku
http://linked.open...ku-zverejnovanych
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software