About: Activity and silencing of mobile elements in mammalian cells.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Activity and silencing of mobile elements in mammalian cells. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
Description	Navrhovaný projekt má čtyři související, avšak dostatečně nezávislé části: První část využije bisulfite sequencing a chromatin IP pro analýzu přirozených epigenetických modifikací šesti potenciálně nejaktivnějších L1 elementů v lidském genomu (zdroj materiálu: stabilní linie a biopsie). Zároveň bude analyzována transkripce a její regulace v těchto šesti lokusech. Druhá část projektu použije bisulfite sequencing DNA z různých myších tkání a vývojových stadií pro popis epigenetického reprogramování transgenního lidského L1 elementu a jeho nových inzercí během reprodukčního cyklu. Třetí část je zaměřena na využití modelu L1 retrotranspozice v buněčné kultuře ke studiu kontroly inhibice L1 a k analýze represivního efektu exprese sense a antisense RNA. Čtvrtá část bude (s využitím buněčných kultur) zkoumat jestli několik invertovaných repetic L1 sekvencí roztroušených v lidském genomu generuje dvouvláknovou RNA (dsRNA) a jestli tato nějak přispívá k represi L1 retrotranspozonu. (cs) This project has four related but sufficiently independent parts: Part I uses bisulfite sequencing and chromatin IP on human samples (biopsies, and stable cell lines) to address natural epigenetic modifications of the six potentially most active human L1 elements. It will also study transcription and its regulation at these six loci. Part II employs bisulfite sequencing of mouse DNA (different tissues and developmental stages) to map epigenetic reprogramming of the transgenic human L1 element and its retrotransposed de novo insertions during the mouse life cycle. Part III focuses on using L1 retrotransposition model in cell culture to study mechanisms involved in the control of L1 silencing and to analyze possible inhibitory effects of simultaneous expression of both RNA strands. Part IV will address (in cell culture) whether several L1 inverted repeats dispersed in the human genome generate double-stranded RNA, which in turn may contribute to L1 silencing. (en)
Title	Aktivita a inhibice mobilních elementů v savčích buňkách. (cs) Activity and silencing of mobile elements in mammalian cells. (en)
http://linked.open...vai/cislo-smlouvy	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/smlouva/IAA501110701
http://linked.open...lsi-vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EE
http://linked.open...avai/druh-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/druh-souteze/VS
http://linked.open...domain/vavai/faze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/faze/36942972
http://linked.open...vavai/hlavni-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EB
http://linked.open...vai/vedlejsi-obor	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/obor/EI
http://linked.open...vavai/id-aktivity	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/aktivita/IA
http://linked.open.../vavai/id-souteze	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/soutez/SAV02007-A
http://linked.open...n/vavai/kategorie	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/kategorie/1
http://linked.open...vai/klicova-slova	repetitive DNA; mobile DNA; LINE; L1; retrotransposon; antisense RNA; RNAi; dsRNA; reverse transcription; RNA silencing; heterochromatin; DNA methylation; bisulfite sequencing; retrotransposition. (en)
http://linked.open...avai/konec-reseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...nujicich-prijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...avai/poskytovatel	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/poskytovatel/AV0
http://linked.open...avai/start-reseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...ai/statni-podpora	3765 (xsd:integer)
http://linked.open...vavai/typProjektu	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/typ/P
http://linked.open...ai/uznane-naklady	3921 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-prijemcu	1 (xsd:integer)
http://linked.open...cet-spoluprijemcu	0 (xsd:integer)
http://linked.open...ai/pocet-vysledku	1 (xsd:integer)
http://linked.open...ku-zverejnovanych	1 (xsd:integer)
is http://linked.open...ain/vavai/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2007/IAA501110701/ico-68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2008/IAA501110701/ico-68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2009/IAA501110701/ico-68378050 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/2010/IAA501110701/ico-68378050

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software