| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - The RNA metabolism of trypanosomatids has many unusual aspects, e.g U-insertion/deletion RNA editing. Much research has focused on the core RNA editing machinery, while other accessory factors, proteins implicated in this process, are in various stages of understanding. We have recently shown, also by solving its crystal structure, that the MRP protein complex has a multifarious role in RNA metabolism. Preliminary data suggest a role in RNA editing and perhaps in other RNA processing for TbRGG1 and REAP1. We propose to further the understanding of these genes via the functional genetic tools available in Trypanosoma brucei to i/ silence specific genes to determine an effect on RNA editing or other RNA processing events; ii/ knock-in tagged wild-type or mutant versions of these genes to find protein partners and determine features that facilitate this binding; iii/ over-express the above and newly discovered proteins for in vitro RNA binding assays and structural studies. (en)
- RNA metabolismus trypanosom má řadu jedinečných vlastností, například editování RNA pomocí inzercí a delecí U. Naše znalosti o mechanismu editování jsou poměrně detailní, zatímco proteiny, které nejsou součástí editosomu, ale podílejí se na editování či stabilitě mt RNA, jsou přehlížené. V současnosti jsme vyřešením krystalické struktury ukázali, že komplex proteinů MRP má schopnost spojovat dvě molekuly RNA. Předběžné údaje naznačují funkci proteinu TbRGG1 a REAP1 nejen při editování, ale rovněž i procesování RNA. Naším cílem je studium funkce těchto genů u Trypanosoma brucei za použití následujících přístupů: i/ vypnout vybrané geny pomocí RNA interference s cílem zjistit jejich funkci při editování a modifikacích RNA; ii/ vnést označené přirozené a mutované verze těchto genů s cílem identifikovat vazebné partnery a studovat jejich vlastnosti; iii/ over-exprimovat tyto a nově identifikované proteiny pro jejich použití in vitro v RNA-vazebných esejích a ve strukturálních studiích. (cs)
|
| Title
| - The role of Trypanosoma brucei RNA binding proteins in mitochondrial transcript processing. (en)
- Úloha RNA vazebných proteinů podílejících se na úpravách mitochondriálních transkriptů u Trypanosoma brucei (cs)
|
| http://linked.open...vai/cislo-smlouvy
| |
| http://linked.open...avai/druh-souteze
| |
| http://linked.open...domain/vavai/faze
| |
| http://linked.open...vavai/hlavni-obor
| |
| http://linked.open...vavai/id-aktivity
| |
| http://linked.open.../vavai/id-souteze
| |
| http://linked.open...n/vavai/kategorie
| |
| http://linked.open...vai/klicova-slova
| - trypanosoma; RNA editing; RNA interference; functional analysis; TbRGG1; REAP1 (en)
|
| http://linked.open...avai/konec-reseni
| |
| http://linked.open...nujicich-prijemcu
| |
| http://linked.open...avai/poskytovatel
| |
| http://linked.open...avai/start-reseni
| |
| http://linked.open...ai/statni-podpora
| |
| http://linked.open...vavai/typProjektu
| |
| http://linked.open...ai/uznane-naklady
| |
| http://linked.open...ai/pocet-prijemcu
| |
| http://linked.open...cet-spoluprijemcu
| |
| http://linked.open...ai/pocet-vysledku
| |
| http://linked.open...ku-zverejnovanych
| |
| is http://linked.open...ain/vavai/projekt
of | |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)