Budou vyvinuty experimentální a teoretické postupy pro molekulární modelování a interpretaci spekter, které umožní lépe porozumět chování molekul ve vybraných oblastech organické chemie a molekulární biologie. Výpočetní metody budou založeny na kombinaci klasických a kvantových metod. Aplikace zahrnují určení vztahu mezi flexibilitou a reaktivitou nových cukerných derivátů, strukturní studie nanomolekulárních komplexů peptidů a porfyrinů s potenciálním využitím v lékařství, peptidů prionového typu a komplexy nukleových kyselin s anti-rakovinnými léčivy. Projekt využívá výhody mnoha technik a kombinuje zkušenosti pracovníku Vysoké školy chemicko-technologické, Karlovy Univerzity a Ústavu organické chemie a biochemie. Předpokládá se i spolupráce s První lékařskou fakultou v Praze a zahraničními laboratořemi. Do projektu bude zapojeno 11 studentů. (cs)
Experimental and theoretical procedures for spectroscopy will be developed that will help to better understand molecular behavior in specific areas of organic chemistry and molecular biology. The computational tools will be based on combined ab initio and molecular dynamics. Application involve problems including relations between flexibility and reactivity of novel saccharide derivatives, resolving structure of nanoassemblies of peptides and porphyrins with a pharmaceutical potential, prion-derived peptides and complexes of nucleic acids and anti-cancer drugs. The project takes advantage of combining multiple techniques and expertise of scientists from different laboratories at the Institute of Chemical Technology, Charles University and the Institute of Organic Chemistry and Biochemistry. Also collaboration with the First Faculty of Medicine in Prague and laboratories abroad is part of the proposal. Eleven students will participate. (en)