| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - Anthokyany, flavonoidní látky, jsou zodpovědné za rozdílné zbarvení obilky pšenice seté (Triticum aestivum L.). Pigmenty tvořené biosyntetickou drahou anthokyanů jsou uloženy v různých částech obilky. Purpurové pigmenty jsou akumulovány v perikarpu a modré pigmenty v aleuronové vrstvě obilky. Z kolekce Agrotestu fyto Kroměříž, s.r.o. byly vybrány vzorky jarní formy pšenice (Novosibirskaja 67, ANK-28B, Abissinskaja arrasajta, UC66049 a Tschermaks Blaukörniger Sommerweizen) s různě zbarvenými obilkami, z kterých byla izolována celková RNA pomocí fenol-chloroformové extrakce. Celková RNA byla přepsána reverzní transkripcí do cDNA. Gen pro GAPDH (glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenasu) byl vybrán jako provozní gen pro ověření úspěšnosti přepisu. Následně byla na cDNA testována optimální teplotní profil PCR reakce pro navržené primery pomocí programu Primer3 a aplikace BLAST. Na základě sekvenace PCR produktů byly získány kandidátní sekvence genů pro chalkon synthasu (82-100% podobnost), pro chalkon isomerasu (podobnost 98-100%) a pro dihydroflavonol reduktasu (95-100% podobnost). Zjištěná variabilita byla způsobena jednonukleotidovým polymorfismem a indely. Primery jsou používány pro studium genové exprese pomocí qPCR.
- Anthokyany, flavonoidní látky, jsou zodpovědné za rozdílné zbarvení obilky pšenice seté (Triticum aestivum L.). Pigmenty tvořené biosyntetickou drahou anthokyanů jsou uloženy v různých částech obilky. Purpurové pigmenty jsou akumulovány v perikarpu a modré pigmenty v aleuronové vrstvě obilky. Z kolekce Agrotestu fyto Kroměříž, s.r.o. byly vybrány vzorky jarní formy pšenice (Novosibirskaja 67, ANK-28B, Abissinskaja arrasajta, UC66049 a Tschermaks Blaukörniger Sommerweizen) s různě zbarvenými obilkami, z kterých byla izolována celková RNA pomocí fenol-chloroformové extrakce. Celková RNA byla přepsána reverzní transkripcí do cDNA. Gen pro GAPDH (glyceraldehyd-3-fosfát dehydrogenasu) byl vybrán jako provozní gen pro ověření úspěšnosti přepisu. Následně byla na cDNA testována optimální teplotní profil PCR reakce pro navržené primery pomocí programu Primer3 a aplikace BLAST. Na základě sekvenace PCR produktů byly získány kandidátní sekvence genů pro chalkon synthasu (82-100% podobnost), pro chalkon isomerasu (podobnost 98-100%) a pro dihydroflavonol reduktasu (95-100% podobnost). Zjištěná variabilita byla způsobena jednonukleotidovým polymorfismem a indely. Primery jsou používány pro studium genové exprese pomocí qPCR. (cs)
- Anthocyanins, flavonoid substances in nature, are responsible for the different pigmented caryopsis of common wheat (Triticum aestivum L.). Anthocyanin biosynthetic pathway is realized in plants by many enzymes from early (CHS -- chalcon sythase, CHI -- chalcon isomerase, and FH -- flavonone hydroxylase) and late (DFR -- dihydroflavonol reductase, ANS -- anthocyanindin synthase and UFGT -- UDP-glucose flavonoid glycosyltransferase) biosynthetic pathway. Pigments formed in this biosynthetic pathway in grain are stored in different layers. Purple pigments are simultaneously accumulated in pericarp and blue pigments are stored in aleurone layer of caryopsis. The field experiment Agrotest Fyto Kroměříž, Ltd. derived samples of ripened caryopsis spring wheat form, selected genotypes (Novosibirskaya 67, ANK-28B, Abyssinskaya Arraseita, UC66049, and Tschermaks Blaukörniger Sommerweizen) with different caryopsis pigment, which from total RNA was isolated using a phenol-chloroform extraction. Total RNA was reverse transcribed into cDNA. House keeping GAPDH gene (the gene for glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase) was chosen as a control for PCR to verify the successful transcription of cDNA. Proven cDNA was subsequently used as a template for gradient PCR to test the optimum temperature annealing for designed primers. There were we searched sequences with a high level of similarity in application BLAST, which served for primer design by Primer3. We detected sequences for CHS genes (82-100% similarity), for CHI genes (98-100% similarity) and for DFR genes (95-100% similarity). The variability was due to single nucleotide polymorphism and indels. The primers will be used for gene expression study by qPCR. (en)
|
| Title
| - Studium kandidátních sekvencí z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice
- Studium kandidátních sekvencí z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice (cs)
- Studies of candidate sequences from wheat anthocyanin bisynthetic pathway (en)
|
| skos:prefLabel
| - Studium kandidátních sekvencí z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice
- Studium kandidátních sekvencí z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice (cs)
- Studies of candidate sequences from wheat anthocyanin bisynthetic pathway (en)
|
| skos:notation
| - RIV/62156489:43210/12:00192817!RIV13-GA0-43210___
|
| http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
| http://linked.open...avai/riv/aktivity
| |
| http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
| http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
| http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open...titaPredkladatele
| |
| http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
| http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/62156489:43210/12:00192817
|
| http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - T. aestivum L.; anthocyanins; wheat; chalcon isomerase; dihydroflavonol reductase; chalcone synthase (en)
|
| http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
| http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
| http://linked.open...v/mistoKonaniAkce
| |
| http://linked.open...i/riv/mistoVydani
| |
| http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| - Pšenice 2012 - od genomu po chleba
|
| http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
| http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
| http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
| http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Havel, Ladislav
- Musilová, Milena
- Ondroušková, Jana
- Trojan, Václav
- Vyhnánek, Tomáš
|
| http://linked.open...vavai/riv/typAkce
| |
| http://linked.open.../riv/zahajeniAkce
| |
| number of pages
| |
| http://purl.org/ne...btex#hasPublisher
| - Výzkumný ústav rostlinné výroby, v. v. i.
|
| https://schema.org/isbn
| |
| http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)