| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| rdfs:seeAlso
| |
| Description
| - At the molecular level, plants use hormone systems to achieve an optimal inner environment for their development and growth. The concentration of plant hormones (like cytokinins) is maintained by enzymes. In our laboratory, we use the maize (Zea mays) beta-D-glucosidase Zm-p60.1 that is involved in regulation of many important processes in plant growth and development. These processes can be changed slightly with mutated forms of Zm-p60.1. Protein engineering offers a means to create variants of this enzyme. These variants have changed substrate specificity towards either natural (trans-zeatin-O-beta-D-glucopyranoside, cis-zeatin-O-beta-D-glucopyranoside) or artificial substrates (p-nitrophenyl-O-beta-D-glucopyranoside, 4-methylumbelliferyl O-beta-Dglucopyranoside). This work deals with generating a mutant library of Zm-p60.1. Based on the previous description of the mutant W373K and bioinformatics analysis of seven plant enzymes similar in sequence to Zm-p60.1 the position 373 was chosen as suitable for combinatorial amino acid mutations. (en)
- Hladiny aktivních hormonů (cytokininy) ovlivňují vývoj rosltin. Jedním z enzymů, který dokáže uvolňovat aktivní cytokininy z neaktivních forem, je beta-D-glukosidasa Zm-p60.1. Různé mutantní varianty enzymu Zm-p60.1 mají odlišnou substrátovou specificitu vůči přírodním (trans-zeatin-O-beta-D-glucopyranoside, cis-zeatin-O-beta-D-glucopyranoside) či umělým (p-nitrophenol-O-beta-Dglukopyranosid) substrátům. A právě tyto mutantní varianty mohou na molekulární úrovni fungovat jako nástroje sloužící k jemným změnám rostlinného metabolismu. Okolí aktivního centra beta-D-glukosidasy obsahuje určité uspořádání aminokyselin (klastr), jež interaguje s aglykonem substrátu. Klastr se skládá z aminokyselin F193, F200, W373 a F461 (Dopitová et al, 2008) (Obr. 1). Prostorové uspořádání klastru bylo porovnáno s dalšími podobnými rostlinnými beta-D-glukosidasami, přístupnými v databázi Carbohydrate-Active enZYmes Database (CAZy, www.cazy.org/) (Henrisat et al., 1997). Na základě již dříve charakterizovaného mutanta W373K a provedené strukturní analýzy byla vytvořena kombinatorická mutageneze enzymu Zm-p60.1 v pozici W373. Naším cílem je vytvořit mutantní knihovnu a následně charakterizovat mutanty vykazující aktivitu na umělýcha přirozených substrátech.
- Hladiny aktivních hormonů (cytokininy) ovlivňují vývoj rosltin. Jedním z enzymů, který dokáže uvolňovat aktivní cytokininy z neaktivních forem, je beta-D-glukosidasa Zm-p60.1. Různé mutantní varianty enzymu Zm-p60.1 mají odlišnou substrátovou specificitu vůči přírodním (trans-zeatin-O-beta-D-glucopyranoside, cis-zeatin-O-beta-D-glucopyranoside) či umělým (p-nitrophenol-O-beta-Dglukopyranosid) substrátům. A právě tyto mutantní varianty mohou na molekulární úrovni fungovat jako nástroje sloužící k jemným změnám rostlinného metabolismu. Okolí aktivního centra beta-D-glukosidasy obsahuje určité uspořádání aminokyselin (klastr), jež interaguje s aglykonem substrátu. Klastr se skládá z aminokyselin F193, F200, W373 a F461 (Dopitová et al, 2008) (Obr. 1). Prostorové uspořádání klastru bylo porovnáno s dalšími podobnými rostlinnými beta-D-glukosidasami, přístupnými v databázi Carbohydrate-Active enZYmes Database (CAZy, www.cazy.org/) (Henrisat et al., 1997). Na základě již dříve charakterizovaného mutanta W373K a provedené strukturní analýzy byla vytvořena kombinatorická mutageneze enzymu Zm-p60.1 v pozici W373. Naším cílem je vytvořit mutantní knihovnu a následně charakterizovat mutanty vykazující aktivitu na umělýcha přirozených substrátech. (cs)
|
| Title
| - Vytváření mutantní knihovny kukuřičného enzymu beta-d-glukosidasy Zm-p60.1
- Vytváření mutantní knihovny kukuřičného enzymu beta-d-glukosidasy Zm-p60.1 (cs)
- Creating mutant library of the maize beta-D-glucosidase Zm-p60.1 (en)
|
| skos:prefLabel
| - Vytváření mutantní knihovny kukuřičného enzymu beta-d-glukosidasy Zm-p60.1
- Vytváření mutantní knihovny kukuřičného enzymu beta-d-glukosidasy Zm-p60.1 (cs)
- Creating mutant library of the maize beta-D-glucosidase Zm-p60.1 (en)
|
| skos:notation
| - RIV/62156489:43210/11:00234791!RIV15-MSM-43210___
|
| http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
| http://linked.open...avai/riv/aktivity
| |
| http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
| http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
| http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open...titaPredkladatele
| |
| http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
| http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/62156489:43210/11:00234791
|
| http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - E.coli transformations; beta-D-glucosidase; mutant library (en)
|
| http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
| http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
| http://linked.open...v/mistoKonaniAkce
| |
| http://linked.open...i/riv/mistoVydani
| |
| http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| - MendelNet 2011 - Proceedings of International Ph.D. Students Conference
|
| http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
| http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
| http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
| http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Brzobohatý, Břetislav
- Filipi, Tomáš
- Mazura, Pavel
- Turek, Dušan
|
| http://linked.open...vavai/riv/typAkce
| |
| http://linked.open...ain/vavai/riv/wos
| |
| http://linked.open.../riv/zahajeniAkce
| |
| number of pages
| |
| http://purl.org/ne...btex#hasPublisher
| - Mendel University in Brno
|
| https://schema.org/isbn
| |
| http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)