About: Detection of polymorphisms in farm animals using direct sequencing of PCR product

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Detection of polymorphisms in farm animals using direct sequencing of PCR product Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
Description	A key step in all strategies for causative gene identification is the resequencing of candidate genes or other genomic regions of interest in phenotype divergent animals to identify those single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with a certain phenotype. DNA sequencing is the determination of all or part of the nucleotide sequence of a specific deoxyribonucleic acid (DNA) molecule. The automated cycle sequencing in combination with a fluorescent labelled primers or ddNTPs is recently mostly used method. We performed the direct sequencing of PCR products using ABI PRISM 310 and ABI PRISM 3100-Avant Genetic Analyzer (Applied Biosystems). The aim of the study was the determination of the porcine MYF6 gene structure by direct sequencing of the PCR product. Length of the sequenced fragment was 379 bp. We detected four polymorphisms in this fragment. All these polymorphisms were located in the intron. A key step in all strategies for causative gene identification is the resequencing of candidate genes or other genomic regions of interest in phenotype divergent animals to identify those single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with a certain phenotype. DNA sequencing is the determination of all or part of the nucleotide sequence of a specific deoxyribonucleic acid (DNA) molecule. The automated cycle sequencing in combination with a fluorescent labelled primers or ddNTPs is recently mostly used method. We performed the direct sequencing of PCR products using ABI PRISM 310 and ABI PRISM 3100-Avant Genetic Analyzer (Applied Biosystems). The aim of the study was the determination of the porcine MYF6 gene structure by direct sequencing of the PCR product. Length of the sequenced fragment was 379 bp. We detected four polymorphisms in this fragment. All these polymorphisms were located in the intron. (en) Klíčovým krokem pro identifikaci kauzálních genů je resekvenování kandidátních genů nebo jiných genomických regionů u fenotypově rozdílných jedinců a identifikace jednonukleotidových polymorfismů (SNP) asociovaných s určitým fenotypem. Sekvenování DNA je určení nukleotidové sekvence celé molekuly DNA nebo její části. V současnosti je nejvýce využívaná metoda cyklického sekvenování v kombinaci s fluorescenčně značenými primery nebo dideoxynukleotidy. My jsme provádeli přímé sekvenování PCR produktu s využitím automatických sekvenátorů ABI PRISM 310 a ABI PRISM 3100-Avant Genetic Analyzer (Applied Biosystems). Cílem naší práce bylo určení struktury prasečího genu MYF6 přímým sekvenováním PCR produktu. Délka sekvenovaného fragmentu byla 379 bp. V tomoto fragmentu jsme detekovali čtyři polymorfismy, všechny jsou lokalizované v intronu. (cs)
Title	Detekce polymorfismů u hospodářských zvířat s využitím přímého sekvenování PCR produktu (cs) Detection of polymorphisms in farm animals using direct sequencing of PCR product Detection of polymorphisms in farm animals using direct sequencing of PCR product (en)
skos:prefLabel	Detekce polymorfismů u hospodářských zvířat s využitím přímého sekvenování PCR produktu (cs) Detection of polymorphisms in farm animals using direct sequencing of PCR product Detection of polymorphisms in farm animals using direct sequencing of PCR product (en)
skos:notation	RIV/62156489:43210/04:00004452!RIV06-GA0-43210___
http://linked.open.../vavai/riv/strany	324;325
http://linked.open...avai/riv/aktivita	P
http://linked.open...avai/riv/aktivity	P(GD523/03/H076)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika	5-6
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2006
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Knoll, Aleš Vykoukalová, Zuzana
http://linked.open.../riv/druhVysledku	J - Článek v odborném periodiku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...titaPredkladatele	Mendelova univerzita v Brně / Agronomická fakulta
http://linked.open...dnocenehoVysledku	559976
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/62156489:43210/04:00004452
http://linked.open...riv/jazykVysledku	eng - angličtina
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	detection of polymorphisms; direct sequencing of PCR product; porcine MYF6 gene (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	detection of polymorphisms direct sequencing of PCR product porcine MYF6 gene
http://linked.open...odStatuVydavatele	CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[6E7F033F9743]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje	Scripta medica (Brno)
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	EB
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	2 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	2 (xsd:int)
http://linked.open...vavai/riv/projekt	Enhancing of Methodological Level and Theoretical Education of Students of the Ph. D. Program 4103V - Animal Husbandry - a Perspective Field General Animal Husb
http://linked.open...UplatneniVysledku	2004
http://linked.open...v/svazekPeriodika	77
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Knoll, Aleš Vykoukalová, Zuzana
issn	1211-3395
number of pages	2 (xsd:int)
http://localhost/t...ganizacniJednotka	43210

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 47 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software