About: Program Application for the Prediction of Results of Protein Digestion by Proteolytic Enzymes     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • Here we introduce the Protein Cutter (http:// biochemie.upol.cz/software/proteincutter), a web application for the prediction of results of protein digestion by proteolytic enzymes, which is accessible over the Internet network. In the beginning, previous and current approaches for protein sequencing are summarized. This includes the use of dinitrofluorobenzene and substituted isothiocyanate reagents as well as mass-spectrometry-based strategies and translation of genomic sequences. The following text characterizes bioinformatics as a modern scientific discipline, which solves problems arising from the management and analysis of biological data. The most important nucleotide and amino acid sequence databases are described together with the databases of DNA and protein structures. The program Protein Cutter, which is described in detail with respect to its design and technology, allows predicting peptide sequences generated by proteolytic digestion of a protein (represented by a user-entered amino acid or coding nucleotide sequence). In addition to other comparable applications, Protein Cutter offers more complex information calculated from amino acid sequences (i.e. molecular mass, amino acid composition, isoelectric point, hydropathicity index etc.), it works with nucleotide sequences upon automatic translation, it is open and friendly for user-entered cutting rules and provides more options for the filtration and sorting of results. (en)
  • Protein Cutter je webová aplikace pro predikci výsledků štěpení proteinů pomocí proteolytických enzymů, která je přístupná prostřednictvím sítě Internet. Program Protein Cutter umožňuje předpovídat sekvence peptidů tvořených proteolytickým štěpením proteinu (daných aminokyselinovou sekvencí nebo kódující nukleotidovou sekvencí). Na rozdíl od jiných srovnatelných aplikací poskytuje Protein Cutter komplexnější informace vypočtené z aminokyselinových sekvencí (např. molekulová hmotnost, aminokyselinové složení, izoelektrický bod, index hydropathie atd.), pracuje s nukleotidovými sekvencemi po automatickém překladu, umožňuje nastavení pravidel štěpení uživatelem a poskytuje další možnosti pro filtraci a třídění výsledků.
  • Protein Cutter je webová aplikace pro predikci výsledků štěpení proteinů pomocí proteolytických enzymů, která je přístupná prostřednictvím sítě Internet. Program Protein Cutter umožňuje předpovídat sekvence peptidů tvořených proteolytickým štěpením proteinu (daných aminokyselinovou sekvencí nebo kódující nukleotidovou sekvencí). Na rozdíl od jiných srovnatelných aplikací poskytuje Protein Cutter komplexnější informace vypočtené z aminokyselinových sekvencí (např. molekulová hmotnost, aminokyselinové složení, izoelektrický bod, index hydropathie atd.), pracuje s nukleotidovými sekvencemi po automatickém překladu, umožňuje nastavení pravidel štěpení uživatelem a poskytuje další možnosti pro filtraci a třídění výsledků. (cs)
Title
  • Program Application for the Prediction of Results of Protein Digestion by Proteolytic Enzymes (en)
  • Programová aplikace pro předpověď výsledků štěpení proteinů
  • Programová aplikace pro předpověď výsledků štěpení proteinů (cs)
skos:prefLabel
  • Program Application for the Prediction of Results of Protein Digestion by Proteolytic Enzymes (en)
  • Programová aplikace pro předpověď výsledků štěpení proteinů
  • Programová aplikace pro předpověď výsledků štěpení proteinů (cs)
skos:notation
  • RIV/61989592:15310/13:33147807!RIV14-MSM-15310___
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(ED0007/01/01)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 1
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 100151
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/61989592:15310/13:33147807
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • Enzymes; Proteolytic; Digestion; Protein; Results; Prediction; Application; Program (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [2EFA468E0233]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Chemické listy
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 107
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Kopečný, David
  • Šebela, Marek
  • Raus, Martin
http://linked.open...ain/vavai/riv/wos
  • 000314263100008
issn
  • 0009-2770
number of pages
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 15310
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software