About: Equilibrium dynamics of spermine-induced plasmid DNA condensation revealed by fluorescence lifetime correlation spectroscopy     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • The spermine-induced DNA condensation is a first-order phase transition. Here, we apply a novel technique fluorescence lifetime correlation spectroscopy to analyze this transition in a greater detail. We show that the method allows for the observation of the condensed and uncondensed molecules simultaneously based solely on different fluorescence lifetimes of the intercalating fluorophore PicoGreen in the folded und unfolded domains of DNA. The auto- and cross-correlation functions reveal that a small fraction of the DNA molecules is involved in the dynamic intramolecular equilibrium. Careful inspection of the cross-correlation curves suggests that folding occurs gradually within milliseconds.
  • The spermine-induced DNA condensation is a first-order phase transition. Here, we apply a novel technique fluorescence lifetime correlation spectroscopy to analyze this transition in a greater detail. We show that the method allows for the observation of the condensed and uncondensed molecules simultaneously based solely on different fluorescence lifetimes of the intercalating fluorophore PicoGreen in the folded und unfolded domains of DNA. The auto- and cross-correlation functions reveal that a small fraction of the DNA molecules is involved in the dynamic intramolecular equilibrium. Careful inspection of the cross-correlation curves suggests that folding occurs gradually within milliseconds. (en)
  • Sperminem indukovaná kondenzace DNA je fázovým přechodem prvního řádu. V tomto článku aplikujeme inovační techniku časově rozlišené fluorescenční korelační spektroskopie k podrobnější analýze této přeměny. Ukazujeme, že tato metoda umožňuje pozorovat zkondensované a nezkondensované molekuly současně, využívaje čistě rozdílné doby života excitovaného stavu interkalujícího barviva PicoGreen ve sbalených a nesbalených doménách molekul DNA. Auto a kroskorelační funkce odhaluje, že do dynamické intramolekulární rovnováhy je zapojena malá část molekul DNA. Pečlivým prozkoumáním kroskorelační křivky lze dojít k závěru, že sbalení se objevuje postupně během několika milisekund. (cs)
Title
  • Equilibrium dynamics of spermine-induced plasmid DNA condensation revealed by fluorescence lifetime correlation spectroscopy
  • Equilibrium dynamics of spermine-induced plasmid DNA condensation revealed by fluorescence lifetime correlation spectroscopy (en)
  • Rovnovážná dynamika sperminem indukované kondenzace plasmidové DNA odhalená pomocí časově rozlišené fluorescenční korelační spektroskopie (cs)
skos:prefLabel
  • Equilibrium dynamics of spermine-induced plasmid DNA condensation revealed by fluorescence lifetime correlation spectroscopy
  • Equilibrium dynamics of spermine-induced plasmid DNA condensation revealed by fluorescence lifetime correlation spectroscopy (en)
  • Rovnovážná dynamika sperminem indukované kondenzace plasmidové DNA odhalená pomocí časově rozlišené fluorescenční korelační spektroskopie (cs)
skos:notation
  • RIV/61388955:_____/08:00311020!RIV09-AV0-61388955
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(1ET400400413), P(IAA400400621), P(LC06063), Z(AV0Z40400503)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 3
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 366429
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/61388955:_____/08:00311020
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • DNA condensation; fluorescence lifetime correlation spectroscopy; ACF (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • US - Spojené státy americké
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [4B38E85C208F]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Biophysical Journal
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 94
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Hof, Martin
  • Kral, Teresa
  • Sýkora, Jan
  • Humpolíčková, Jana
  • Macháň, Radek
  • Benda, Aleš
  • Enderlain, J.
  • Gasinska, B.
http://linked.open...ain/vavai/riv/wos
  • 000252243200001
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
issn
  • 0006-3495
number of pages
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software