| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a molecular biology method used for the detection of bacteria (phylum, genus, species) in activated sludge based on knowledge of their specific sequences in nucleic acids using fluorescently labeled gene probes. The first and essential step is to fix samples. There are several different techniques of fixation, so the first part of this experiment is focused on finding the optimum method. As the optimal fixation procedure was evaluated the one in which the highest percentage of target bacteria in the same sample of activated sludge was detected. Effect of activated sludge solids to the results of quantification was observed in the next part of the experiment. The aim was to test whether used solids affects the values obtained by quantification and whether the results of two samples with different solids are comparable. It was thus found that the solids of the sludge is needed to modify before analysis or not. Another questionable step of FISH analysis is its final part, the quantification of the identified bacteria. It was necessary to find the optimal number of analyses per sample and the optimal amount of photos for one analysis of one sample sufficient for reliable quantification of the results. As an optimum amount of analyses and photographs was designated the lowest number when results weren't affected. (en)
- Fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je metoda molekulární biologie, která je využívána pro detekci bakterií (říše, rod, druh) v aktivovaném kalu na základě znalosti specifických sekvencí v jejich nukleových kyselinách, s využitím fluorescenčně označených genových sond. Prvním a zásadním krokem celé analýzy je fixace vzorků. Existuje několik různých postupů pro fixaci vzorků, proto je první část tohoto experimentu zaměřena na nalezení metody optimální. Jako optimální postup fixace byl vyhodnocen postup, při kterém bylo detekováno nejvyšší procento cílových bakterií v jednom vzorku aktivovaného kalu. Vliv použité sušiny aktivovaného kalu na výsledky kvantifikace byl sledován v další části experimentu. Cílem bylo vyzkoušet, zda použitá sušina ovlivňuje hodnoty získané kvantifikací a zda jsou výsledky dvou vzorků s různou sušinou porovnatelné. Bylo tedy zjištěno, zda je potřeba sušinu kalu před analýzou upravovat, či nikoliv. Posledním diskutabilním krokem analýzy FISH je její konečná část, kvantifikace identifikovaných bakterií. Bylo potřeba najít optimální počet analýz jednoho vzorku a optimální množství fotografií pro jednu analýzu jednoho vzorku, postačující pro spolehlivé výsledky z kvantifikace. Za optimální počet analýz i fotografií byl určen jejich nejnižší počet, kdy ještě nebyl ovlivněn výsledek.
- Fluorescenční in situ hybridizace (FISH) je metoda molekulární biologie, která je využívána pro detekci bakterií (říše, rod, druh) v aktivovaném kalu na základě znalosti specifických sekvencí v jejich nukleových kyselinách, s využitím fluorescenčně označených genových sond. Prvním a zásadním krokem celé analýzy je fixace vzorků. Existuje několik různých postupů pro fixaci vzorků, proto je první část tohoto experimentu zaměřena na nalezení metody optimální. Jako optimální postup fixace byl vyhodnocen postup, při kterém bylo detekováno nejvyšší procento cílových bakterií v jednom vzorku aktivovaného kalu. Vliv použité sušiny aktivovaného kalu na výsledky kvantifikace byl sledován v další části experimentu. Cílem bylo vyzkoušet, zda použitá sušina ovlivňuje hodnoty získané kvantifikací a zda jsou výsledky dvou vzorků s různou sušinou porovnatelné. Bylo tedy zjištěno, zda je potřeba sušinu kalu před analýzou upravovat, či nikoliv. Posledním diskutabilním krokem analýzy FISH je její konečná část, kvantifikace identifikovaných bakterií. Bylo potřeba najít optimální počet analýz jednoho vzorku a optimální množství fotografií pro jednu analýzu jednoho vzorku, postačující pro spolehlivé výsledky z kvantifikace. Za optimální počet analýz i fotografií byl určen jejich nejnižší počet, kdy ještě nebyl ovlivněn výsledek. (cs)
|
| Title
| - Optimization of FISH analysis for the identification and quantification of bacteria in activated sludge (en)
- Optimalizace postupu analýzy FISH pro identifikaci a kvantifikaci bakterií v aktivovaném kalu
- Optimalizace postupu analýzy FISH pro identifikaci a kvantifikaci bakterií v aktivovaném kalu (cs)
|
| skos:prefLabel
| - Optimization of FISH analysis for the identification and quantification of bacteria in activated sludge (en)
- Optimalizace postupu analýzy FISH pro identifikaci a kvantifikaci bakterií v aktivovaném kalu
- Optimalizace postupu analýzy FISH pro identifikaci a kvantifikaci bakterií v aktivovaném kalu (cs)
|
| skos:notation
| - RIV/60461373:22320/14:43897091!RIV15-MPO-22320___
|
| http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
| http://linked.open...avai/riv/aktivity
| |
| http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
| http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
| http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open...titaPredkladatele
| |
| http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
| http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/60461373:22320/14:43897091
|
| http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - nitrifying bacteria; rRNA; activated sludge; optimization of the method; FISH (en)
|
| http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
| http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
| http://linked.open...v/mistoKonaniAkce
| |
| http://linked.open...i/riv/mistoVydani
| |
| http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| |
| http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
| http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
| http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
| http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Růžičková, Iveta
- Chovancová, Lucie
|
| http://linked.open...vavai/riv/typAkce
| |
| http://linked.open.../riv/zahajeniAkce
| |
| number of pages
| |
| http://purl.org/ne...btex#hasPublisher
| - Vodní zdroje Ekomonitor s.r.o.
|
| https://schema.org/isbn
| |
| http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)