About: STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Coding regions of the mitochondrial genome are highly conservative among species and genera. However, the sequences of introns and regions between genes can be highly variable, because they do not contain sequences necessary for the function of organelles. There were evaluated a total of 145 genotypes belonging to 16 species of the genus Solanum. No polymorphism was detected by analysis of nad2/4/nad2/5. There were also used primer pair for mt atp9/atp9 intron and the pair of primers rrn5/rrn18-1 intergenic spacer. Analysis on a horizontal agarose gel, using SSCP and DGGE detected no polymorphism. The last used marker mapped cox1/cox1 intron. There was detected fragment variability only in the species S. mochiquense by using restriction enzyme Hinf1. The sequencing of the fragment atp9/atp9 results, that this intergenic spacer shows relatively low variability among the species of different families, which suggest a high conservation degree across the plant kingdom. (en)
  • Kódující oblasti v mitochondriálním genomu jsou vysoce konzervativní mezi druhy i rody. Nicméně sekvence intronů a oblastí mezi geny jsou vysoce variabilní, protože neobsahují sekvence nezbytné pro funkci organel. Bylo zhodnoceno celkem 145 genotypů náležících k 16 druhům rodu Solanum. Analýzou markeru nad2/4/nad2/5 nebyl detekován polymorfismus. Dále byly použity pár mt primerů atp9/atp9 a pár primerů rrn5/rrn18-1. Analýzou na horizontálním agarózovém gelu, metodou SSCP a DGGE nebyl detekován polymorfismus. Posledním použitým markerem byl cox1/cox1. Restrikčním štěpením fragmentu enzymem Hinf1 byla detekována variabilita pouze u druhu S. mochiquense. Ze sekvenování fragmentu atp9/atp9 vyplývá, že tento intergenový mezerník vykazuje mezi druhy různých čeledí relativně nízkou variabilitu, z čehož lze usuzovat na vysokou míru konzervovanosti napříč rostlinnou říší. Získané výsledky potvrzují hypotézu, že mitochondriální DNA vykazuje obecně nízkou variabilitu.
  • Kódující oblasti v mitochondriálním genomu jsou vysoce konzervativní mezi druhy i rody. Nicméně sekvence intronů a oblastí mezi geny jsou vysoce variabilní, protože neobsahují sekvence nezbytné pro funkci organel. Bylo zhodnoceno celkem 145 genotypů náležících k 16 druhům rodu Solanum. Analýzou markeru nad2/4/nad2/5 nebyl detekován polymorfismus. Dále byly použity pár mt primerů atp9/atp9 a pár primerů rrn5/rrn18-1. Analýzou na horizontálním agarózovém gelu, metodou SSCP a DGGE nebyl detekován polymorfismus. Posledním použitým markerem byl cox1/cox1. Restrikčním štěpením fragmentu enzymem Hinf1 byla detekována variabilita pouze u druhu S. mochiquense. Ze sekvenování fragmentu atp9/atp9 vyplývá, že tento intergenový mezerník vykazuje mezi druhy různých čeledí relativně nízkou variabilitu, z čehož lze usuzovat na vysokou míru konzervovanosti napříč rostlinnou říší. Získané výsledky potvrzují hypotézu, že mitochondriální DNA vykazuje obecně nízkou variabilitu. (cs)
Title
  • STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM
  • STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM (cs)
  • STUDY OF MITOCHONDRIAL DNA NON-CODING REGIONS VARIABILITY IN SELECTED GENE RESOURCES OF GENUS SOLANUM (en)
skos:prefLabel
  • STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM
  • STUDIUM VARIABILITY NEKÓDUJÍCÍCH OBLASTÍ MITOCHONDRIÁLNÍ DNA U VYBRANÝCH GENOVÝCH ZDROJŮ RODU SOLANUM (cs)
  • STUDY OF MITOCHONDRIAL DNA NON-CODING REGIONS VARIABILITY IN SELECTED GENE RESOURCES OF GENUS SOLANUM (en)
skos:notation
  • RIV/60460709:41210/11:51431!RIV12-MSM-41210___
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • Z(MSM6046070901)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 0
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 233002
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/60460709:41210/11:51431
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • mitochondrial DNA, Solanum, non-coding regions, SSCP, DGGE, sequencing (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [BDBD3DC7AC99]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Vědecké práce
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 18
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Domkářová, Jaroslava
  • Sedlák, Petr
  • Sedláková, Vladimíra
  • Horáčková, Vendulka
http://linked.open...ain/vavai/riv/wos
  • 0
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
issn
  • 1802-940X
number of pages
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 41210
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software