About: Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Application of molecular phylogenetics in the traditional fashion may, in many cases, be insufficient or even improper for solving evolutionary problems. These limitations are due to such factors as a scarcity/ambiguity of phylogenetic information in the sequences, an intricacy of gene relationships at low phylogenetic levels, or a lack of criteria when deciding among several competing coevolutionary scenarios. In this review, novel approaches potentially applicable to parasitological research are presented and their advantages as well as drawbacks are discussed. These issues include the usage of idiosyncratic markers (unique features with presumably low probability of homoplasy), such as insertion of mobile elements, gene rearrangements and secondary structure features; the problem of ancestral polymorphism and reticulate relationships at low phylogenetic levels; and the utility of a molecular clock to facilitate discrimination among alternative scenarios in host–parasite coevolution.
  • Application of molecular phylogenetics in the traditional fashion may, in many cases, be insufficient or even improper for solving evolutionary problems. These limitations are due to such factors as a scarcity/ambiguity of phylogenetic information in the sequences, an intricacy of gene relationships at low phylogenetic levels, or a lack of criteria when deciding among several competing coevolutionary scenarios. In this review, novel approaches potentially applicable to parasitological research are presented and their advantages as well as drawbacks are discussed. These issues include the usage of idiosyncratic markers (unique features with presumably low probability of homoplasy), such as insertion of mobile elements, gene rearrangements and secondary structure features; the problem of ancestral polymorphism and reticulate relationships at low phylogenetic levels; and the utility of a molecular clock to facilitate discrimination among alternative scenarios in host–parasite coevolution. (en)
  • Použití metod molekulární fylogenetiky v její tradiční podobě může být při řešení některých evolučních otázek nedostatečné nebo přímo zavádějící. Toto omezení vyplývá z různých faktů, jako je například nedostatek či neprůkaznost fylogenetické informace v sekvencích DNA, složitost vztahů mezi geny na nízké fylogenetické úrovni, nebo absence kritérií pro volbu mezi alternativními koevolučními hypotézami. Prezentované review přináší přehled nových přístupů potenciálně využitelných v parazitologickém výzkumu a diskutuje jejich výhody i nedostatky. Tyto přístupy zahrnují 1) využití „idiosynkratických“ znaků (jedinečných znaků s nízkou úrovní homoplazií), jako jsou například mobilní elementy, genové uspořádání a prvky sekundární struktury DNA, 2) řešení ancestrálního polymorfismu a retikulárních vztahů na nízké fylogenetické úrovni, 3) využití molekulárních hodin při volbě mezi alternativními hypotézami o koevoluci parazita a hostitele. (cs)
Title
  • Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers
  • Historie parazitů a nové fylogenetické metody: alternativní přístupy k rekonstrukci evoluce parazitů z molekulárních dat (cs)
  • Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers (en)
skos:prefLabel
  • Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers
  • Historie parazitů a nové fylogenetické metody: alternativní přístupy k rekonstrukci evoluce parazitů z molekulárních dat (cs)
  • Parasite histories and novel phylogenetic tools: alternative approaches to inferring parasite evolution from molecular markers (en)
skos:notation
  • RIV/60077344:_____/06:00051237!RIV07-AV0-60077344
http://linked.open.../vavai/riv/strany
  • 141;155
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(GA206/04/0520), Z(AV0Z60220518)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 2
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 491512
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/60077344:_____/06:00051237
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • molecular phylogeny; parasite evolution (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • AU - Australské společenství
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [9BF2DA350B3E]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • International Journal for Parasitology
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 36
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Hypša, Václav
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
issn
  • 0020-7519
number of pages
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software