Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
Description
| - Intensive breeding provides on the one hand the production of elite genotypes and a wide range of modern varieties, but on the other hand, narrows the genetic background, which complicates the identifications of individual genotypes. These factors further increase pressure on the need for reliable tools to identify individual genotypes/varieties. One of these tools is the use of molecular markers, which in comparison with morphological characteristics, have high predictive value. Among the most suitable markers for the assessment of variability within varieties, and often used to characterize important traits, are microsatellites. The aim of this study was to verify the suitability of modified fluorescently-labeled primers for multiplex analysis of microsatellites in oilseed rape, where eight microsatellite primers derived from database Brassica DB were selected. Genotyping was facilitated by the use of four primer pairs labelled with different fluorescent probes, enabling efficient multiplex detection. With this modification, it was possible to significantly reduce the cost of fragmentation analysis, while maintaining the use of this marker for genetic diversity at the level of individual varieties. (en)
- Intenzivní šlechtění vede na jedné straně k produkci elitních genotypů a širokého spektra moderních odrůd, ale na straně druhé dochází k zužování genetické základny a mnohdy problematickému odlišení jednotlivých genotypů. Tyto faktory pak ještě více zesilují tlak na potřebu spolehlivých nástrojů pro identifikaci jednotlivých genotypů/odrůd. Jedním z těchto nástrojů jsou právě molekulární markery, které mají ve srovnání s morfologickými znaky vysokou vypovídající hodnotu. Za jednu z nejvhodnějších technik pro hodnocení variability na úrovni odrůd a technikou velmi často používanou pro charakterizaci a markerování významných znaků jsou mikrosatelity. Cílem této studie bylo ověřit vhodnost použití modifikovaných fluorescenčně značených primerů pro multiplexovou analýzu mikrosatelitů u řepky. Celkem bylo vybráno 8 mikrosatelitových primerů získaných z databáze Brassica DB. Koncepce genotypizace pomocí těchto primeru byla rozšířena o možnost použití čtyř odlišně fluorescenčně značených primerů umožňující výkonnější multiplexovou detekci. Díky této modifikaci bylo možné dosáhnout výrazného snížení nákladů na fragmentační analýzu a přitom zachovat využití tohoto markeru pro stanovení genetické diverzity na úrovni jednotlivých odrůd.
- Intenzivní šlechtění vede na jedné straně k produkci elitních genotypů a širokého spektra moderních odrůd, ale na straně druhé dochází k zužování genetické základny a mnohdy problematickému odlišení jednotlivých genotypů. Tyto faktory pak ještě více zesilují tlak na potřebu spolehlivých nástrojů pro identifikaci jednotlivých genotypů/odrůd. Jedním z těchto nástrojů jsou právě molekulární markery, které mají ve srovnání s morfologickými znaky vysokou vypovídající hodnotu. Za jednu z nejvhodnějších technik pro hodnocení variability na úrovni odrůd a technikou velmi často používanou pro charakterizaci a markerování významných znaků jsou mikrosatelity. Cílem této studie bylo ověřit vhodnost použití modifikovaných fluorescenčně značených primerů pro multiplexovou analýzu mikrosatelitů u řepky. Celkem bylo vybráno 8 mikrosatelitových primerů získaných z databáze Brassica DB. Koncepce genotypizace pomocí těchto primeru byla rozšířena o možnost použití čtyř odlišně fluorescenčně značených primerů umožňující výkonnější multiplexovou detekci. Díky této modifikaci bylo možné dosáhnout výrazného snížení nákladů na fragmentační analýzu a přitom zachovat využití tohoto markeru pro stanovení genetické diverzity na úrovni jednotlivých odrůd. (cs)
|
Title
| - Multiplexová analýza mikrosatelitů u řepky pomocí modifikovaných fluorescenčně značených primerů
- Multiplexová analýza mikrosatelitů u řepky pomocí modifikovaných fluorescenčně značených primerů (cs)
- Microsatellite genotyping with 4-color fluorescent detection using multiple-tailed primers in oilseed rape (en)
|
skos:prefLabel
| - Multiplexová analýza mikrosatelitů u řepky pomocí modifikovaných fluorescenčně značených primerů
- Multiplexová analýza mikrosatelitů u řepky pomocí modifikovaných fluorescenčně značených primerů (cs)
- Microsatellite genotyping with 4-color fluorescent detection using multiple-tailed primers in oilseed rape (en)
|
skos:notation
| - RIV/60076658:12220/14:43887804!RIV15-MZE-12220___
|
http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivity
| |
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
| |
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
http://linked.open...titaPredkladatele
| |
http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/60076658:12220/14:43887804
|
http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - Brassica napus, molecular markers, genetic diversity, SSR, breeding (en)
|
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
http://linked.open...odStatuVydavatele
| |
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| - Úroda : časopis pro rostlinnou produkci
|
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
http://linked.open...v/svazekPeriodika
| |
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Čurn, Vladislav
- Jozová, Eva
|
issn
| |
number of pages
| |
http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |