About: Stanovenie kmeňov E.coli schopných produkcie putrescínu a kadaverínu s pomocou metód PCR

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Stanovenie kmeňov E.coli schopných produkcie putrescínu a kadaverínu s pomocou metód PCR Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
Description	In our study, the ornithine (speC) and lysine (cadA) decarboxylase genes were investigated in E. coli strains using the PCR methods. 30 E. coli strains isolated from raw cow, sheep and goat bulk milk samples and cheeses obtained from different farms were evaluated. The alignment of the multiple sequences and analysis of conserved domains in the studied genes was carried out using ClustalW and BLAST programs. Analysis of the sequence sources for the speC gene revealed existence of speC isosyme, featured with homology between the 66–98 % compared to the speC nucleotide alignment. Also, in the case of cadA gene, we observed two groups of sequences with the homology of approximately 60 % (GenBank, cadA1, cadA2). On the basement of these facts, we designed and performed also additional PCR tests. 77 % strains were positive for speC, 73 % for speC isozyme gene, 60 % for cadA1 and 53 % for cadA2 PCR test. The production of individual amines in tested samples was successfully verified. (en) V prezentovanej práci boli s pomocou metód PCR investigované gény ornitín (speC) a lyzín (cadA) dekarboxylázy v skupine izolátov E. coli. Testovanú skupinu kmeňov predstavovalo 30 kmeňov E. coli izolovaných zo surového kravského, ovčieho a kozieho mlieka a syra, vzorky pochádzali z viacerých fariem. Na porovnanie sekvencií skúmaných génov a na analýzu konzervovaných domén a štruktúry proteínov boli použité programy ClustalW a BLAST. Analýza dostupných sekvencií génu speC odhalila existenciu génu pre speC izozým, ktorého nukleotidové usporiadanie vykazovalo homológiu v intervale 66–98% v porovnaní so sekvenciou speC. Rovnako v prípade génu cadA sme zaznamenali existenciu dvoch skupín sekvencií s homológiou približne 60 % (GenBank, cadA1, cadA2). Na základe týchto faktov sme navrhli a optimalizovali doplnkové PCR testy. 77% kmeňov bolo pozitívnych na speC, 73% na prítomnosť génu speC izozým, 60% na cadA1 a 53% na cadA2 PCR test. Produkcia jednotlivých amínov v testovaných vzorkách bola úspešne overená.
Title	Stanovenie kmeňov E.coli schopných produkcie putrescínu a kadaverínu s pomocou metód PCR PCR identification of the E.coli strains competent for production of putrescine and cadaverine (en)
skos:prefLabel	Stanovenie kmeňov E.coli schopných produkcie putrescínu a kadaverínu s pomocou metód PCR PCR identification of the E.coli strains competent for production of putrescine and cadaverine (en)
skos:notation	RIV/26788462:_____/10:#0000375!RIV11-MSM-26788462
http://linked.open...avai/riv/aktivita	P Z
http://linked.open...avai/riv/aktivity	P(2B08069), P(LA10029), Z(MSM2678846201)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika	4
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2011
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Manga, Ivan
http://linked.open.../riv/druhVysledku	J - Článek v odborném periodiku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...titaPredkladatele	Agrovýzkum Rapotín s.r.o.
http://linked.open...dnocenehoVysledku	289833
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/26788462:_____/10:#0000375
http://linked.open...riv/jazykVysledku	sla - slovenština
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	putrescine; cadaverine; PCR; E.coli (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	putrescine PCR cadaverine E.coli
http://linked.open...odStatuVydavatele	CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[ACB50F338722]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje	Výzkum v chovu skotu
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	EB
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	1 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	2 (xsd:int)
http://linked.open...vavai/riv/projekt	Relationship research of contaminant microflora and biogenic amines as the risk toxicants in the system of cheese health unexceptionability on the consumer market Support of the membership and cooperation with the Society for Applied Microbiology (SfAM).
http://linked.open...UplatneniVysledku	2010
http://linked.open...v/svazekPeriodika	52
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Manga, Ivan Vyletělová, Marcela
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer	Uplatnění evropského modelu multifunkčního zemědělství v LFA oblastech České republiky
issn	0139-7265
number of pages	7 (xsd:int)

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software