Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
rdfs:seeAlso
| |
Description
| - Software with a user interface allow to plot and analyze phylogenetic tree based on biological sequences in FASTA file with adjustable parameters (statistical method, distance model, scoring matrix, number of replications, number of active sequences). All phylogenetic trees and analyzes based upon them are constructed using the neighbor-joining method. Used statistical methods are Bootstrapping, Jackknifing, OTU Jackknifing, permutation tail probability test. (en)
- Software opatřen uživatelským rozhraním umožňující ze souboru biologických sekvencí ve FASTA souboru vykreslit a analyzovat fylogenetický strom na základě nastavitelných parametrů (statistická metoda, distanční model, skórovací matice, počet replikací, počet aktivních sekvencí). Veškeré fylogenetické stromy, či analýzy založené na nich, jsou konstruovány pomocí metody Neighbor-Joining. Využívanými statistickými metodami jsou Bootstrapping, Jackknifing, OTU Jackknifing, permutation tail probability test.
- Software opatřen uživatelským rozhraním umožňující ze souboru biologických sekvencí ve FASTA souboru vykreslit a analyzovat fylogenetický strom na základě nastavitelných parametrů (statistická metoda, distanční model, skórovací matice, počet replikací, počet aktivních sekvencí). Veškeré fylogenetické stromy, či analýzy založené na nich, jsou konstruovány pomocí metody Neighbor-Joining. Využívanými statistickými metodami jsou Bootstrapping, Jackknifing, OTU Jackknifing, permutation tail probability test. (cs)
|
Title
| - PhylogenTree Analyzer
- PhylogenTree Analyzer (en)
- PhylogenTree Analyzer (cs)
|
skos:prefLabel
| - PhylogenTree Analyzer
- PhylogenTree Analyzer (en)
- PhylogenTree Analyzer (cs)
|
skos:notation
| - RIV/00216305:26220/14:PR27862!RIV15-GA0-26220___
|
http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
http://linked.open...avai/riv/aktivity
| |
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
http://linked.open...onomickeParametry
| |
http://linked.open...titaPredkladatele
| |
http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/00216305:26220/14:PR27862
|
http://linked.open...terniIdentifikace
| |
http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - phylogenetic tree, substitution matrix, scoring matrix, distance matrix, evolutionary model, Neighbor-Joining, Bootstrapping, Jackknifing, PTP test, Permutation Tail Probability, OTU jackknifing, resampling tests (en)
|
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
http://linked.open...echnickeParametry
| - Software byl realizován jako výsledek projektu GAČr Nano-elektro-bio-nástroje pro biochemické a molekulárně-biologické studie eukaryotických buněk (NanoBioTECell). Produkt je využíván na VUT v Brně a na Mendelově univerzitě, Ústav chemie a biochemie. Pro spuštění programu je zapotřebí MATLAB 2012b nebo novější verze. Software je volně stažitelný na adrese http://www.dbme.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty.
|
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Provazník, Ivo
- Sedlář, Karel
- Škutková, Helena
- Koščová, Pavlína
- Vadják, Šimon
|
http://linked.open...avai/riv/vlastnik
| |
http://linked.open...itiJinymSubjektem
| |
http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |