| Attributes | Values |
|---|
| rdf:type
| |
| Description
| - Red clover (T. pratense L.) is one of the most important forage crops in the Czech Republic. Clover genomes are highly variable and polymorphic because of their alogamy and strong gametophytic self-incompatibility. A diploid variety Start (T. pratense, 2n = 14, 418 Mbp) was selected for whole-genome sequencing by Illumina. Assemblied contigs were searched by SSRLocator for microsatelite loci, which were used for design of 69 714 SSR markers. Validation of selected 99 SSR markers was conducted on a set of 39 czech red clover varieties. 16 highly polymorphic markers were used to asses intraspecific diversity and identification of 26 czech varieties. 8 selected polymorphic markers were used to estimate variability of hybrid varienty Pramedi using a PIC (Polymorphic Information Content) value. (en)
- Jetel luční (T. pratense L.) je jednou z nejvýznamnějších pícnin v České republice. Genomy jetelů jsou kvůli cizosprašnosti a silné gametofytické inkompatibilitě vysoce variabilní a polymorfní. Pro sekvenaci pomocí platformy Illumina byla vybrána diploidní odrůda jetele lučního Start (2n = 14, 418 Mbp). Ve výsledných poskládaných kontizích byly pomocí programu SSRLocator vyhledány mikrosatelitní lokusy, z kterých bylo odvozeno celkem 69 714 SSR markerů. Pro validaci na 39 českých odrůdách jetele lučního byl vybrán soubor celkem 99 SSR markerů. 16 vysoce polymorfních markerů bylo použito pro hodnocení vnitrodruhové diverzity a identifikaci 26 českých odrůd jetele lučního. 8 vybraných polymorfních markerů bylo použito pro hodnocení variability hybridní odrůdy Pramedi pomocí koeficientu PIC (polymorphic information content).
- Jetel luční (T. pratense L.) je jednou z nejvýznamnějších pícnin v České republice. Genomy jetelů jsou kvůli cizosprašnosti a silné gametofytické inkompatibilitě vysoce variabilní a polymorfní. Pro sekvenaci pomocí platformy Illumina byla vybrána diploidní odrůda jetele lučního Start (2n = 14, 418 Mbp). Ve výsledných poskládaných kontizích byly pomocí programu SSRLocator vyhledány mikrosatelitní lokusy, z kterých bylo odvozeno celkem 69 714 SSR markerů. Pro validaci na 39 českých odrůdách jetele lučního byl vybrán soubor celkem 99 SSR markerů. 16 vysoce polymorfních markerů bylo použito pro hodnocení vnitrodruhové diverzity a identifikaci 26 českých odrůd jetele lučního. 8 vybraných polymorfních markerů bylo použito pro hodnocení variability hybridní odrůdy Pramedi pomocí koeficientu PIC (polymorphic information content). (cs)
|
| Title
| - Využití diverzity mikrosatelitních lokusů získaných sekvenováním další generace u jetele
- Využití diverzity mikrosatelitních lokusů získaných sekvenováním další generace u jetele (cs)
- Utilization of diversity in SSR loci from next-generation sequencing in Trifolium (en)
|
| skos:prefLabel
| - Využití diverzity mikrosatelitních lokusů získaných sekvenováním další generace u jetele
- Využití diverzity mikrosatelitních lokusů získaných sekvenováním další generace u jetele (cs)
- Utilization of diversity in SSR loci from next-generation sequencing in Trifolium (en)
|
| skos:notation
| - RIV/00216224:14310/14:00073262!RIV15-MSM-14310___
|
| http://linked.open...avai/riv/aktivita
| |
| http://linked.open...avai/riv/aktivity
| - P(EE2.4.31.0155), P(QI111A019), S
|
| http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
| |
| http://linked.open...aciTvurceVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/druhVysledku
| |
| http://linked.open...iv/duvernostUdaju
| |
| http://linked.open...titaPredkladatele
| |
| http://linked.open...dnocenehoVysledku
| |
| http://linked.open...ai/riv/idVysledku
| - RIV/00216224:14310/14:00073262
|
| http://linked.open...riv/jazykVysledku
| |
| http://linked.open.../riv/klicovaSlova
| - Trifolium; clover; sequencing; NGS; SSR; PIC; diversity (en)
|
| http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
| |
| http://linked.open...ontrolniKodProRIV
| |
| http://linked.open...v/mistoKonaniAkce
| - Konferenční centrum hotelu Continental
|
| http://linked.open...i/riv/mistoVydani
| |
| http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
| - XVI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů
|
| http://linked.open...in/vavai/riv/obor
| |
| http://linked.open...ichTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...cetTvurcuVysledku
| |
| http://linked.open...vavai/riv/projekt
| |
| http://linked.open...UplatneniVysledku
| |
| http://linked.open...iv/tvurceVysledku
| - Pátková, Lenka
- Řepková, Jana
- Soldánová, Martina
- Ištvánek, Jan
- Dluhošová, Jana
|
| http://linked.open...vavai/riv/typAkce
| |
| http://linked.open.../riv/zahajeniAkce
| |
| number of pages
| |
| http://purl.org/ne...btex#hasPublisher
| |
| https://schema.org/isbn
| |
| http://localhost/t...ganizacniJednotka
| |
![[RDF Data]](/fct/images/sw-rdf-blue.png)
![[cxml]](/fct/images/cxml_doc.png)
![[csv]](/fct/images/csv_doc.png)
![[text]](/fct/images/ntriples_doc.png)
![[turtle]](/fct/images/n3turtle_doc.png)
![[ld+json]](/fct/images/jsonld_doc.png)
![[rdf+json]](/fct/images/json_doc.png)
![[rdf+xml]](/fct/images/xml_doc.png)
![[atom+xml]](/fct/images/atom_doc.png)
![[html]](/fct/images/html_doc.png)