About: The use of DNA microarray technology in research of genetic cause of schizophrenia     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Rychlý rozvoj technik využívajících DNA čipy umožnil v posledních době provádění genotypizace velkého množství jednobodových polymorfismů (SNPs) v rámci GWAS (genome-wide association studies). V rámci naší studie, zabývající se analýzou SNPs asociovaných s rizikem vzniku schizofrenie, jsme provedli návrh DNA čipu pro analýzu 96 SNPs pomocí metody GoldenGate na přístroji BeadExpress reader (Illumina). Při výběru byly zohledněny výsledky posledních GWAS (Genome Wide Association Studies) studií s našimi předchozími výsledky. Celkem bylo analyzováno 405 vzorků pacientů a kontrol mužského pohlaví. Průměrná call rate u vzorků byla 98%, kdy do následné statistické analýzy byly použity pouze vzorky s call rate vyšší než 90%. Po analýze výsledků pomocí Fisherova dvoustranného testu a Bonferroniho korekci bylo nalezeno šest polymorfismů (rs6595788, rs28705343, rs3737967, rs77692880, rs9960767 a rs6104567) signifikantně asociovaných s rizikem vzniku schizofrenie (p < 0.05).
  • Rychlý rozvoj technik využívajících DNA čipy umožnil v posledních době provádění genotypizace velkého množství jednobodových polymorfismů (SNPs) v rámci GWAS (genome-wide association studies). V rámci naší studie, zabývající se analýzou SNPs asociovaných s rizikem vzniku schizofrenie, jsme provedli návrh DNA čipu pro analýzu 96 SNPs pomocí metody GoldenGate na přístroji BeadExpress reader (Illumina). Při výběru byly zohledněny výsledky posledních GWAS (Genome Wide Association Studies) studií s našimi předchozími výsledky. Celkem bylo analyzováno 405 vzorků pacientů a kontrol mužského pohlaví. Průměrná call rate u vzorků byla 98%, kdy do následné statistické analýzy byly použity pouze vzorky s call rate vyšší než 90%. Po analýze výsledků pomocí Fisherova dvoustranného testu a Bonferroniho korekci bylo nalezeno šest polymorfismů (rs6595788, rs28705343, rs3737967, rs77692880, rs9960767 a rs6104567) signifikantně asociovaných s rizikem vzniku schizofrenie (p < 0.05). (cs)
  • Fast development of microarray techniques in recent years has allowed us to perform genotyping of large number of single nucleotide polymorphisms (SNPs) as a part of GWAS (genome-wide association studies). In our study we have observing SNPs associated with a risk of developing schizophrenia. We have designed DNA microarray analyzing 96 SNPs using GoldenGate method on BeadExpress reader (Illumina). In the selection we have followed the results of recent GWAS (Genome Wide Association Studies) and those from our previous studies. The whole analysis comprised 405 men samples from patients and healthy controls. The avarage call rate in our samples was 98%, while in further statistic analysis we have used only those samples with call rate above 90%. After analysis using Fisher two-tailed test a Bonferroni corrections we have found six polymorphisms (rs6595788, rs28705343, rs3737967, rs77692880, rs9960767 a rs6104567) significantly associated with a risk of developing schizophrenia (p < 0.05). (en)
Title
  • The use of DNA microarray technology in research of genetic cause of schizophrenia (en)
  • Využití DNA čipové technologie ve výzkumu genetické podmíněnosti schizofrenie
  • Využití DNA čipové technologie ve výzkumu genetické podmíněnosti schizofrenie (cs)
skos:prefLabel
  • The use of DNA microarray technology in research of genetic cause of schizophrenia (en)
  • Využití DNA čipové technologie ve výzkumu genetické podmíněnosti schizofrenie
  • Využití DNA čipové technologie ve výzkumu genetické podmíněnosti schizofrenie (cs)
skos:notation
  • RIV/00216224:14310/13:00066097!RIV14-GA0-14310___
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(GP309/09/P361)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 115962
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/00216224:14310/13:00066097
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • microarray technology; schizophrenia; polymorfhism (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [1D67D1D9E118]
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Šerý, Omar
  • Lochman, Jan
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 14310
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software