About: Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • Spirocheta T pallidum ssp. pallidum, původce syfilis, je obligátní lidský patogen. Tuto treponemu nelze kultivovat v podmínkách in vitro. Sekvenace genomu a následná konstrukce BAC knihovny v E. coli otevřely nové možnosti výzkumu T. pallidum (např. studium regulace transkripce). Studium regulátorů jsme prováděli v klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Geny rpoN (kódující 54 faktor) a fhlA (kódující aktivátor transkripce) byly naklonovány do expresních, arabinózou indukovatelných, plazmidů pBAD/HisB, které jsou kompatibilní s replikačním systémem kosmidu BAC. Vyšetřili jsme růstovou křivku kmene DH10B s rekombinantními plazmidy. Metodou Q-PCR jsme vyšetřili expresi vybraných treponemálních genů po indukci exprese genů rpoN a fhlA. 54 závislé promotory jsme identifikovali analýzou in silico a předpovězené transkripty následně mapovali pomocí PCR z cDNA. Proteiny RpoN a FhlA jsou tedy pozitivní regulátory genové exprese a ovlivňují transkripci několika treponemálních genů.
  • Spirocheta T pallidum ssp. pallidum, původce syfilis, je obligátní lidský patogen. Tuto treponemu nelze kultivovat v podmínkách in vitro. Sekvenace genomu a následná konstrukce BAC knihovny v E. coli otevřely nové možnosti výzkumu T. pallidum (např. studium regulace transkripce). Studium regulátorů jsme prováděli v klonech BAC knihovny T. pallidum v E. coli DH10B. Geny rpoN (kódující 54 faktor) a fhlA (kódující aktivátor transkripce) byly naklonovány do expresních, arabinózou indukovatelných, plazmidů pBAD/HisB, které jsou kompatibilní s replikačním systémem kosmidu BAC. Vyšetřili jsme růstovou křivku kmene DH10B s rekombinantními plazmidy. Metodou Q-PCR jsme vyšetřili expresi vybraných treponemálních genů po indukci exprese genů rpoN a fhlA. 54 závislé promotory jsme identifikovali analýzou in silico a předpovězené transkripty následně mapovali pomocí PCR z cDNA. Proteiny RpoN a FhlA jsou tedy pozitivní regulátory genové exprese a ovlivňují transkripci několika treponemálních genů. (cs)
  • Spirochete T. pallidum ssp. pallidum, the causative agent of syphilis, is an obligate human pathogen that cannot be cultured continuously under in vitro conditions. Genome sequencing and constructions of BAC library of treponemal DNA in E. coli open new areas for the next studies (e.g. for the study on gene expression regulation). Genes rpoN (coding for 54 factor) and fhlA (coding for putative transcriptional activator) were cloned into the arabinose-inducible expression vector pBAD/HisB. Q-PCR technique was used for the study of putative gene regulation mediated by RpoN and FhlA in the clones of the BAC library. 54-dependent promoters were identified in the T. pallidum genome using in silico approach and the predicted transcripts were mapped by PCR technique. Proteins RpoN and FhlA are positive regulators of gene expression of several treponemal genes. (en)
Title
  • Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.
  • PUTATIVE GENE EXPRESSION REGULATORS AND 54-DEPENDENT PROMOTERS OF THE SPIROCHETE TREPONEMA PALLIDUM (en)
  • Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum. (cs)
skos:prefLabel
  • Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.
  • PUTATIVE GENE EXPRESSION REGULATORS AND 54-DEPENDENT PROMOTERS OF THE SPIROCHETE TREPONEMA PALLIDUM (en)
  • Studium domnělých regulátorů genové exprese a sigma 54-závislých promotorů spirochety Treponema pallidum. (cs)
skos:notation
  • RIV/00216224:14110/05:00013196!RIV10-MZ0-14110___
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(GA310/04/0021), P(NI7351), Z(MSM0021622415)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 545100
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/00216224:14110/05:00013196
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • Treponema pallidum subsp. pallidum; gene expression profiling; BAC clones (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [9D40BFBE2293]
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Čejková, Darina
  • Šmajs, David
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 14110
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 107 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software