About: Genomic restriction profiles of the selected strains of the genus Treponema

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Genomic restriction profiles of the selected strains of the genus Treponema Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
Description	Byl získán restrikční profil 52 oblastí (69 % genomu) u studovaných treponemálních kmenů. U dvou oblastí (TPI8 a TPI48) byla zjištěna delece v genomu T. paraluiscuniculi. Delece v TPI8 je přibližně 200 bp velká a nachází se v nekódující oblasti. Delece v TPI48 je velká přibližně 2,7 kb a zahrnuje 4 geny tprI, tprJ a dva geny kódující oblasti o neznámé funkci. U jedné oblasti (TPI2) byla nalezena inzerce o velikosti přibližně 150 bp v genomu T. paraluiscuniculi. U 16 TPI oblastí byl nalezen odlišný restrikční profil: u 2 oblastí T. pallidum subsp. pertenue Samoan D a u 15 oblastí T. paraluiscuniculi. Rozdílného restrikčního profilu v oblasti TPI80 (jak u kmene Samoan D, tak a u T. paraluiscuniculi) při štěpení Xba I bylo využito k jejich odlišení od ostatních kmenů. U zbývajících oblastí byl nalezen stejný restrikční profil pro jednotlivá štěpení příslušnými restrikčními enzymy. Výsledky naznačují vysokou míru sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny. Ačkoliv je patogenita studovaných treponemálních Byl získán restrikční profil 52 oblastí (69 % genomu) u studovaných treponemálních kmenů. U dvou oblastí (TPI8 a TPI48) byla zjištěna delece v genomu T. paraluiscuniculi. Delece v TPI8 je přibližně 200 bp velká a nachází se v nekódující oblasti. Delece v TPI48 je velká přibližně 2,7 kb a zahrnuje 4 geny tprI, tprJ a dva geny kódující oblasti o neznámé funkci. U jedné oblasti (TPI2) byla nalezena inzerce o velikosti přibližně 150 bp v genomu T. paraluiscuniculi. U 16 TPI oblastí byl nalezen odlišný restrikční profil: u 2 oblastí T. pallidum subsp. pertenue Samoan D a u 15 oblastí T. paraluiscuniculi. Rozdílného restrikčního profilu v oblasti TPI80 (jak u kmene Samoan D, tak a u T. paraluiscuniculi) při štěpení Xba I bylo využito k jejich odlišení od ostatních kmenů. U zbývajících oblastí byl nalezen stejný restrikční profil pro jednotlivá štěpení příslušnými restrikčními enzymy. Výsledky naznačují vysokou míru sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny. Ačkoliv je patogenita studovaných treponemálních (cs) Genomes of T. pallidum subsp. pallidum and closely related treponemes were amplified using XL PCR and digested with BamH I, EcoR I a Hind III (or Spe I, Xba I a Xho I). Genetic differences were identified and discussed. (en)
Title	Genomic restriction profiles of the selected strains of the genus Treponema (en) Restrikční profil genomů vybraných zástupců rodu Treponema Restrikční profil genomů vybraných zástupců rodu Treponema (cs)
skos:prefLabel	Genomic restriction profiles of the selected strains of the genus Treponema (en) Restrikční profil genomů vybraných zástupců rodu Treponema Restrikční profil genomů vybraných zástupců rodu Treponema (cs)
skos:notation	RIV/00216224:14110/04:00012108!RIV08-GA0-14110___
http://linked.open.../vavai/riv/strany	275
http://linked.open...avai/riv/aktivita	P
http://linked.open...avai/riv/aktivity	P(GA310/04/0021), P(NI7351)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika	A
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2008
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Šmajs, David Strouhal, Michal
http://linked.open.../riv/druhVysledku	J - Článek v odborném periodiku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...titaPredkladatele	Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
http://linked.open...dnocenehoVysledku	584549
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/00216224:14110/04:00012108
http://linked.open...riv/jazykVysledku	cze - čeština
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	T. pallidum; T. paraluiscuniculi (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	T. pallidum T. paraluiscuniculi
http://linked.open...odStatuVydavatele	CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[74D797D76B16]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje	Bulletin Československé společnosti mikrobiologické
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	EB
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	2 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	2 (xsd:int)
http://linked.open...vavai/riv/projekt	Postgenomic studies on Treponema pallidum, the syphilis spirochete Comparative genomics of pathogenic spirochetes of the genus Treponema: the route towards sequence-specific diagnostics
http://linked.open...UplatneniVysledku	2004
http://linked.open...v/svazekPeriodika	XXXXV
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Strouhal, Michal Šmajs, David
issn	0009-0646
number of pages	1 (xsd:int)
http://localhost/t...ganizacniJednotka	14110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software