About: Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • DNA microarray technology was utilized to study gene expression by the syphilis spirochete Treponema pallidum subsp. pallidum (Nichols) isolated from rabbit testes 10 days post infection. Microarrays containing all 1039 annotated ORFs of Treponema pallidum subspecies pallidum (Nichols) were printed on glass slides. For 1034 ORFs (out of 1039), signals higher than the threshold (average of negative control spots + 3 SDs) were detected for both RNA and DNA probes. The most highly transcribed genes were found to correlate with the most conspicuous spots identified by two dimensional gel electrophoresis, indicating that the transcript levels generally corresponded to the relative protein concentrations. Genes with high transcript concentrations included those encoding flagellar filament and cytoplasmic filament proteins, prominent lipoproteins and membrane proteins, chaperonins, proteins involved in red-ox balance, chemotaxis regulatory proteins, a V-ATPase operon, and certain metabolic enzymes such as gl (en)
  • Byla studována úroveň genové exprese u spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum (kmen Nichols) kultivované v podmínkách in vivo v králičích varlatech. Spirochety byly izolovány 10 dní po inokulaci a poté z nich byla izolována chromosomální DNA a celková RNA. DNA a RNA byla - po označení flourescenčními barvivy - hybridizována na DNA čipech, které obsahují PCR produkty všech 1039 predikovaných genů T. pallidum. Nejsilněji transkribované geny (geny s nejvyšším poměrem mezi značenou RNA a DNA) odpovídaly proteinům s nejvýraznějším signálem identifikovaným na dvourozměrné gelové elektroforéze. Tyto geny kódují flagelární a cyplasmatické filamentární proteiny, lipoproteiny a membránové antigeny, chaperoniny, proteiny treponemálního redox systému, chemotaktické regulační proteiny, komponenty V-ATPázového systému a některé enzymy (např. glykolytické dráhy). Výsledky získané pomocí DNA čipů byly nezávisle potvrzeny pomocí PCR analýzy v reálném čase. Stanovení genové exprese touto metodou u 84 genů vykaz
  • Byla studována úroveň genové exprese u spirochety Treponema pallidum subsp. pallidum (kmen Nichols) kultivované v podmínkách in vivo v králičích varlatech. Spirochety byly izolovány 10 dní po inokulaci a poté z nich byla izolována chromosomální DNA a celková RNA. DNA a RNA byla - po označení flourescenčními barvivy - hybridizována na DNA čipech, které obsahují PCR produkty všech 1039 predikovaných genů T. pallidum. Nejsilněji transkribované geny (geny s nejvyšším poměrem mezi značenou RNA a DNA) odpovídaly proteinům s nejvýraznějším signálem identifikovaným na dvourozměrné gelové elektroforéze. Tyto geny kódují flagelární a cyplasmatické filamentární proteiny, lipoproteiny a membránové antigeny, chaperoniny, proteiny treponemálního redox systému, chemotaktické regulační proteiny, komponenty V-ATPázového systému a některé enzymy (např. glykolytické dráhy). Výsledky získané pomocí DNA čipů byly nezávisle potvrzeny pomocí PCR analýzy v reálném čase. Stanovení genové exprese touto metodou u 84 genů vykaz (cs)
Title
  • Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků
  • Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků (cs)
  • Transkriptome of Treponema pallidum: gene expression levels during experimental rabbit infection (en)
skos:prefLabel
  • Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků
  • Transkriptom spirochety Treponema pallidum: úroveň genové exprese během experimentální infekce králíků (cs)
  • Transkriptome of Treponema pallidum: gene expression levels during experimental rabbit infection (en)
skos:notation
  • RIV/00216224:14110/03:00012309!RIV/2005/MZ0/141105/N
http://linked.open.../vavai/riv/strany
  • 14 - 15
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(NI7351)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 631364
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/00216224:14110/03:00012309
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • transcriptome, treponema pallidum (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [B259D801CAD3]
http://linked.open...v/mistoKonaniAkce
  • Brno, Komenského nám. 2
http://linked.open...i/riv/mistoVydani
  • Brno
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Sborník abstraktů XII. konference mladých mikrobiologů Tomáškovy dny 2003
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Matějková, Petra
  • Šmajs, David
  • Norris, S. J.
  • Weinstock, G. M.
http://linked.open...vavai/riv/typAkce
http://linked.open.../riv/zahajeniAkce
number of pages
http://purl.org/ne...btex#hasPublisher
  • Masarykova univerzita. Lékařská fakulta
http://localhost/t...ganizacniJednotka
  • 14110
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software