About: Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
Description
  • The manuscript deals with the method of two-dimensional differential gel electrophoresis (2D-DIGE) and its application in proteomics. First, the method of 2D-DIGE is characterised and compared to %22classical%22 denaturating 2-DE, especially 2D SDS-PAGE. The main focus is given on protein sample preparation, especially sample labelling with CyDyes fluorescent dyes. In addition, protein separation and subsequent detection of labelled protein is described. In conclusion, the main advatages (separation of two different protein samples plus an internal standard in one gel - reduction of inter-gel variability, avoiding problems with gel reproducibility) and disadvatages (higher costs on 2D-DIGE gels - costs on sample labelling with CyDyes, costs on fluorescent scanner for detection of protein spots labelled with CyDyes; minimal labelling - inability to detect proteins without lysine residues; saturation labelling - inability to detect proteins without cysteine residues) are discussed. (en)
  • Příspěvek se zabývá popisem metody dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2D-DIGE) a možnostmi jejího využití v proteomice. Důraz je kladen zvláště na ty aspekty metody 2D-DIGE, které se odlišují od %22klasické%22 dvourozměrné denaturační elektroforézy (2D SDS-PAGE), tj. značení proteinových vzorků fluorescenčními barvivy CyDyes, dělení vzorků a detekce jednotlivých proteinových skvrn (spotů). V závěru jsou stručně shrnuty hlavní výhody a nevýhody metody 2D-DIGE (možnost současného rozdělení dvou různých vzorků v jednom gelu včetně interního standardu - alespoň částečná eliminace potíží s reproducibilitou gelů; vyšší pořizovací náklady na fluorescenční scanner pro detekci proteinů označených barvivy CyDyes; v případě tzv. minimálního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují lysin; v případě tzv. saturačního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují cystein).
  • Příspěvek se zabývá popisem metody dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2D-DIGE) a možnostmi jejího využití v proteomice. Důraz je kladen zvláště na ty aspekty metody 2D-DIGE, které se odlišují od %22klasické%22 dvourozměrné denaturační elektroforézy (2D SDS-PAGE), tj. značení proteinových vzorků fluorescenčními barvivy CyDyes, dělení vzorků a detekce jednotlivých proteinových skvrn (spotů). V závěru jsou stručně shrnuty hlavní výhody a nevýhody metody 2D-DIGE (možnost současného rozdělení dvou různých vzorků v jednom gelu včetně interního standardu - alespoň částečná eliminace potíží s reproducibilitou gelů; vyšší pořizovací náklady na fluorescenční scanner pro detekci proteinů označených barvivy CyDyes; v případě tzv. minimálního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují lysin; v případě tzv. saturačního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují cystein). (cs)
Title
  • Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice
  • The method of tvo-dimensional differential gel electrophoresis and its application in proteomics (en)
  • Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice (cs)
skos:prefLabel
  • Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice
  • The method of tvo-dimensional differential gel electrophoresis and its application in proteomics (en)
  • Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice (cs)
skos:notation
  • RIV/00027006:_____/10:00001157!RIV11-GA0-00027006
http://linked.open...avai/riv/aktivita
http://linked.open...avai/riv/aktivity
  • P(GP522/09/P621), P(OC08066), Z(MZE0002700604)
http://linked.open...iv/cisloPeriodika
  • 7
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat
http://linked.open...aciTvurceVysledku
http://linked.open.../riv/druhVysledku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju
http://linked.open...titaPredkladatele
http://linked.open...dnocenehoVysledku
  • 270752
http://linked.open...ai/riv/idVysledku
  • RIV/00027006:_____/10:00001157
http://linked.open...riv/jazykVysledku
http://linked.open.../riv/klicovaSlova
  • 2D-DIGE; CyDyes fluorescent dyes; quantitative protein evaluation; proteomics (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo
http://linked.open...odStatuVydavatele
  • CZ - Česká republika
http://linked.open...ontrolniKodProRIV
  • [3DE2B2CCA847]
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje
  • Chemické listy
http://linked.open...in/vavai/riv/obor
http://linked.open...ichTvurcuVysledku
http://linked.open...cetTvurcuVysledku
http://linked.open...vavai/riv/projekt
http://linked.open...UplatneniVysledku
http://linked.open...v/svazekPeriodika
  • 104
http://linked.open...iv/tvurceVysledku
  • Kosová, Klára
  • Prášil, Ilja
  • Vítámvás, Pavel
  • Škodáček, Zbyněk
http://linked.open...n/vavai/riv/zamer
issn
  • 0009-2770
number of pages
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software