About: Possibility of variance of transcription detection after stressors treatment

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Possibility of variance of transcription detection after stressors treatment Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	skos:Concept http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Vysledek
Description	We studied a possibility to use real-time PCr for gene expression profilling. Expression of Dhn gene in barley as a response to cold stress was taken as a model. Lengt polymorphism of the gene was not recorded. By the use of optimised protocol we showed changes in Dhn 6, 7, 9, 11 expression. (en) Studovali jsme možnost využití kvantitativní PCR v reálném čase (QRT PCR) pro sledování zrněn v expresi genů po působení stresorů. Jako modelová rostlina byl zvolen ječmen. V rámci modelového experimentu byl sledován vliv chladového stresu. Je známo, že následkem chladového stresu se zvyšuje produkce některých proteinů, které jsou označovány jako dehydriny. Nebyly zaznamenán délkový polymorfismus sledovaných amplikonů mezi 3 odrůdami. V rámci studie jsme optimalizovali jednotlivé kroky QRT PCR analýzy. Jako nejvhodnější z testovaných postupů izolace RNA nejlepší výsledky poskytl protokol s využitím sady Quiagen. Použití oligodT zajistilo efektivní průběh reverzní transkripce. Výsledek QRT PCR byl závislý na výchozí koncentraci RNA v reakční směsi. V rozsahu experimentálního uspořádání bylo možné využít jako referenční gen ubiquitin. Za testovaných podmínek chladového stresu jsme nezjistili změny a rozdíly v expresi genů Dhn 6, 7, 9, 11. Změny v expresi genů Dhn 5 a 8 byly zaznamenány. QRT PCR lze pov Studovali jsme možnost využití kvantitativní PCR v reálném čase (QRT PCR) pro sledování zrněn v expresi genů po působení stresorů. Jako modelová rostlina byl zvolen ječmen. V rámci modelového experimentu byl sledován vliv chladového stresu. Je známo, že následkem chladového stresu se zvyšuje produkce některých proteinů, které jsou označovány jako dehydriny. Nebyly zaznamenán délkový polymorfismus sledovaných amplikonů mezi 3 odrůdami. V rámci studie jsme optimalizovali jednotlivé kroky QRT PCR analýzy. Jako nejvhodnější z testovaných postupů izolace RNA nejlepší výsledky poskytl protokol s využitím sady Quiagen. Použití oligodT zajistilo efektivní průběh reverzní transkripce. Výsledek QRT PCR byl závislý na výchozí koncentraci RNA v reakční směsi. V rozsahu experimentálního uspořádání bylo možné využít jako referenční gen ubiquitin. Za testovaných podmínek chladového stresu jsme nezjistili změny a rozdíly v expresi genů Dhn 6, 7, 9, 11. Změny v expresi genů Dhn 5 a 8 byly zaznamenány. QRT PCR lze pov (cs)
Title	Possibility of variance of transcription detection after stressors treatment (en) Možnosti detekce změny transkripce po působení stresorů Možnosti detekce změny transkripce po působení stresorů (cs)
skos:prefLabel	Possibility of variance of transcription detection after stressors treatment (en) Možnosti detekce změny transkripce po působení stresorů Možnosti detekce změny transkripce po působení stresorů (cs)
skos:notation	RIV/00027006:_____/03:196!RIV08-MZE-00027006
http://linked.open.../vavai/riv/strany	90;93
http://linked.open...avai/riv/aktivita	P
http://linked.open...avai/riv/aktivity	P(QC1336)
http://linked.open...vai/riv/dodaniDat	2008
http://linked.open...aciTvurceVysledku	Prášil, Ilja Kučera, Ladislav Ovesná, Jaroslava
http://linked.open.../riv/druhVysledku	D - Článek ve sborníku
http://linked.open...iv/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open...titaPredkladatele	Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
http://linked.open...dnocenehoVysledku	616592
http://linked.open...ai/riv/idVysledku	RIV/00027006:_____/03:196
http://linked.open...riv/jazykVysledku	cze - čeština
http://linked.open.../riv/klicovaSlova	real-time PCR; ubiquitin; exprese; gene (en)
http://linked.open.../riv/klicoveSlovo	exprese gene ubiquitin real-time PCR
http://linked.open...ontrolniKodProRIV	[012903C94E69]
http://linked.open...v/mistoKonaniAkce	Výzkumný ústav rostlinné výroby, Praha
http://linked.open...i/riv/mistoVydani	Výzkumný ústav rostlinné výroby, ČZU Praha
http://linked.open...i/riv/nazevZdroje	Vliv abiotických a biotických stresorů na vlastnosti rostlin
http://linked.open...in/vavai/riv/obor	EB
http://linked.open...ichTvurcuVysledku	3 (xsd:int)
http://linked.open...cetTvurcuVysledku	3 (xsd:int)
http://linked.open...vavai/riv/projekt	Development and employment of new approaches for monitoring of genetic diversity and large-scale screening of genetic resources
http://linked.open...UplatneniVysledku	2003
http://linked.open...iv/tvurceVysledku	Kučera, Ladislav Ovesná, Jaroslava Prášil, Ilja
http://linked.open...vavai/riv/typAkce	WRD - Světová
http://linked.open.../riv/zahajeniAkce	2003-10-08 (xsd:date)
number of pages	4 (xsd:int)
http://purl.org/ne...btex#hasPublisher	Výzkumný ústav rostlinné výroby, ČZU Praha
https://schema.org/isbn	80-86555-27-5

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 48 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software