About: BRCA1 alternative splicing variants and their prognostic and predictive role in breast cancer

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: BRCA1 alternative splicing variants and their prognostic and predictive role in breast cancer Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=NT12280
Description	The aim of the project is identification of BRCA1 splicing variants specificity regarding their significance as a prognostic factors and predictive markers of breast cancer. cDNA will be synthesized from RNA isolated from mammary tissue samples received from breast cancer patients and from women without breast cancer and from their peripheral blood. BRCA1 mRNA splicing variants will be identified using cDNA as a template for PCR amplification with primers localized in 5´ and 3´ BRCA1 UTR and subsequently analyzed by fragmentation gel electrophoresis (Agilent 2100). Detected BRCA1 splicing variants will be cloned into TA – cloning vector and sequenced. Tissue specific expression of particular variants will be quantified by qPCR. Differences between splicing patterns of lymphocytes and mammary tissue within patients with breast cancer and controls will be statistically evaluated. BRCA1 splicing variants within breast cancer patients will be evaluated in relation to disease course and treatment. (en) Cílem projektu je identifikace tkáňové specifičnosti sestřihových forem genu BRCA1 s ohledem na jejich význam jako prognostických a prediktivních ukazatelů karcinomu prsu. Vzorky RNA izolované z peroperačně získané mamární tkáně pacientek s ca prsu a žen bez nádoru podstupujících mamoplastiku a izolované z periferní krve budou sloužit pro syntézu cDNA. Sestřihové varianty BRCA1 mRNA budou z cDNA amplifikovány s primery zasahujícími 5' a 3' UTR sekvece BRCA1 a analyzovány fragmentační gelovou elektroforézou (Agilent 2100). Alternativní sestřihové varianty budou zaklonovány pomocí TA-klonování do vektorů a sekvenačně charakterizovány ze získaných plasmidů. Tkáňová exprese jednotlivých variant BRCA1 bude kvantifikována pomocí qPCR. Statisticky budou vyhodnoceny rozdíly v sestřihovém vzorci buněk periferní krve a mamy a mezi pacientkami s ca prsu a nenádorovou populací, u pacientek s ca prsu budou vyhodnoceny sestřihové vzorce BRCA1 mRNA ve vztahu k průběhu a léčbě onemocnění.
Title	BRCA1 alternative splicing variants and their prognostic and predictive role in breast cancer (en) Prognostický a prediktivní význam alternativních sestřihových variant genu BRCA1 u karcinomu prsu
skos:notation	NT12280
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Ministry of Health’s Departmental Research and Development Programme III
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NT12280/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NT12280/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2015-01-22 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	100116588
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	FD - Onkologie a hematologie
http://linked.open...vai/cep/kategorie	NV - Aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového výzkumu (tzv. %22neprůmyslový výzkum%22)
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	breast cancer; hereditary breast cancer; breast cancer predisposition; breast cancer predictive facto; BRCA1 gene; splicing; alternative splicing (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	1. lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	2 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	2 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2013-03-26 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/NT12280-4%2F2011
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2014
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2014
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMZ0201101
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DRRVK
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2014-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2011-06-01 (xsd:date)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBK
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	breast cancer BRCA1 gene breast cancer predictive facto breast cancer predisposition hereditary breast cancer splicing
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2011/ico%3A00064165 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2011/ico%3A00064211 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2011/orjk%3A11110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2012/ico%3A00064165 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2012/ico%3A00064211 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2012/orjk%3A11110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2013/ico%3A00064165 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2013/ico%3A00064211 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2013/orjk%3A11110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2014/ico%3A00064165 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2014/ico%3A00064211 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NT12280/2014/orjk%3A11110

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software