About: Molecular typing of Treponema pallidum subsp. pallidum strains and isolates: the background for epidemiological and clinical identifications of individual strains

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Molecular typing of Treponema pallidum subsp. pallidum strains and isolates: the background for epidemiological and clinical identifications of individual strains Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=NR8967
Description	The main aim of this project is to collect over one hundred strains and clinical isolates of T. pallidum ssp. pallidum, the causative agent of syphilis. Variable parts of the genomes will be amplified and sequenced. Molecular identification of individual Treponema pallidum ssp. pallidum strains and isolates is important for epidemiologic consequences and for clinical discrimination between reinfection and reactivation of the syphylitic process. (en) Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu. Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR amplifikace a RFLP.
Title	Molecular typing of Treponema pallidum subsp. pallidum strains and isolates: the background for epidemiological and clinical identifications of individual strains (en) Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
skos:notation	NR8967
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Branch programm of research of the Ministry of Health
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NR8967/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/NR8967/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2011-04-27 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65803499
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	V - Vynikající výsledky (s mezinárodním významem apod.). Zároveň byly splněny cíle a předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory.
http://linked.open...vai/cep/kategorie	NV - Aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového výzkumu (tzv. %22neprůmyslový výzkum%22)
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Treponema pallidum; comparative genomics; PCR diagnostics; SNP (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Lékařská fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	50 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	50 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-12-18 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/NR8967-4%2F2006
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMZ02006NR
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2006-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	18 type strains of genus Treponema and 389 clinical specimens from 252 patients were collected. Type strains were analysed by whole genome fingerprinting and MLST.Clinical samples were tested for treponemal DNA. New typing scheme was developed. (en) Bylo shromážděno 18 typových kmenů rodu Treponema a 389 klinických vzorků od 252 pacientů. Typové kmeny byly vyšetřeny metodou whole genome fingerprinting a MLST, klinické vzorky vyšetřena přítomnost DNA. Navržen nový typovací systém pro klinické vzorky. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Treponema pallidum comparative genomics PCR diagnostics
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2007/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2007/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2008/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2008/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2009/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2009/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2010/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2010/orjk%3A14110 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2006/ico%3A00159816 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/NR8967/2006/orjk%3A14110

Faceted Search & Find service v1.16.121 as of Mar 31 2025

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Mar 31 2025, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 30 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2025 OpenLink Software