About: Amino acid modification and their influence on biocatalyst stability.

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Amino acid modification and their influence on biocatalyst stability. Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=MEB060910
Description	The objective of the proposal is the detailed investigation of amino acid modifications of pyranose 2-oxidase (P2Ox) enzyme during substrate conversion and the study of their influence on the enzyme stability. Mass spectrometry will be used to identify the modifications induced either by the reaction with the by-product (H2O2) or with the product of the conversion (keto-sugars). The main goal of the proposed project is to study various molecular aspects of operational stability of P2Ox, namely: (i) identification of Met residue oxidation (in the vicinity of the active center as well as surface-exposed) and (ii) identification of possible formation of Schiff bases of surface-exposed Lys residues with keto-sugars. The modified amino acids will be exchanged by site-directed mutagenenis in order to assess the influence of these modifications on the stability of P2Ox under operational conditions. (en) Předmětem tohoto návrhu je výzkum aminokyselinových modifikací u enzymu pyranose 2-oxidázy (P2Ox) generovaných během přeměny substrátu a studie vlivu těchto modifikací na stabilitu enzymu. Metody hmotnostní spektrometrie budou použity k identifikaci modifikovaných aminokyselin vyvolaných buď reakcí enzymu s vedlejším produktem (H2O2) nebo s produktem přeměny (ketocukr). Hlavním cílem projektu je studium molekulárních aspektů stability P2Ox, a to zejména: (i) identifikace oxidace Met aminokyselinových zbytků jak v blízkostí aktivního centra, tak i zbytků lokalizovaných na povrchu enzymu a dále (ii) identifikace možné tvorby Schiffových bazí povrchových lysinových zbytků s ketocukry. Modifikované aminokyseliny budou nahrazeny bodovými mutacemi s cílem stanovit vliv těchto aminokyselin na stabilitu enzymu.
Title	Amino acid modification and their influence on biocatalyst stability. (en) Modifikace aminokyselin a jejich vliv ma stabilitu enzymových biokatalyzátorů.
skos:notation	MEB060910
http://linked.open...avai/cep/aktivita	KONTAKT
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/MEB060910/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/MEB060910/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2011-06-30 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	82466799
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	pyranose 2-oxidase; enzyme stability; amino acid modifications; mass spectrometry; site-directed mutagenenis (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	0 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2010-06-09 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/7326%2F2010-32
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2010
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2011
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SMSM2008ME3
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2010-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2009-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	We found Phe454 as being oxidized during sugar conversion using pyranose 2-oxidase, which led to an inactivation of the enzyme. Based on the results we suggest that Phe454 plays a crucial role in the active loop site during the substrate binding. (en) Fenylalanin v pozici 454 je oxidován během enzymatické konverze sacharidu pomocí pyranosa 2-oxidasy, což vede k inaktivaci enzymu. Na základě výsledků lze předpokládat, že Phe454 hraje klíčovou roli v aktivním centru během vazby substrátu. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	mass spectrometry amino acid modifications enzyme stability pyranose 2-oxidase
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB060910/2009/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB060910/2010/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/MEB060910/2011/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software