About: Collaboration with Bioversity International on global analysis and conservation of genetic diversity of bananas     Goto   Sponge   NotDistinct   Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

AttributesValues
rdf:type
rdfs:seeAlso
Description
  • This project will contribute to the conservation and use of genetic diversity of bananas and plantains. The investigations will include all accessions held in the global gene bank as well as the accessions which will be newly introduced to the bank. The experiments will be performed using the recently established genotyping platform, and will include flow cytometric estimation of ploidy and genome size, and analysis using 19 microsatellite (SSR) markers. The accessions, which will not give clear results after SSR genotyping, will be used for sequence analysis of ITS locus. This complex approach will result in detailed description of genetic diversity and facilitate identification of mixed and mixoploid accessions in the gene bank. The results will shed light on the evolution and genomic constitution of edible banana clones and characterize genetic diversity and phylogenetic relationships within the family Musaceae. (en)
  • Cílem projektu je prohloubit a rozšířit spolupráci s Bioversity International a charakterizovat genetickou diversitu zástupců čeledi Musaceae uchovávaných ve světové genové bance (asi 500 položek) a to včetně nových položek, které budou v době řešení projektu do banky zařazovány (asi 150 položek). Analýzy budou prováděny s využitím genotypovací platformy v laboratoři řešitele. Díky komplexnímu přístupu, který kromě genotypování pomocí 19 mikrosatelitových markerů využívá informace o ploidii budou identifikovány položky obsahující více genotypů, mixoploidní položky, nesprávně popsané položky a duplikované položky. U položek, u kterých genotypování pomocí mikrosatelitových markerů neposkytne jednoznačné výsledky, budou analyzovány nukleotidové sekvence krátkého mezerníku 45S rRNA genů (ITS sekvence). Získaná data budou použita pro fylogenetickou analýzu s cílem objasnit původ pěstovaných forem banánovníku.
Title
  • Collaboration with Bioversity International on global analysis and conservation of genetic diversity of bananas (en)
  • Spolupráce s Bioversity International na globální analýze a uchovávání genetické diverzity banánovníku
skos:notation
  • LG12021
http://linked.open...avai/cep/aktivita
http://linked.open...kovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
http://linked.open...vai/cep/kategorie
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
  • Musaceae; gene bank; genetic diversity; ploidy level; genome size; microsatellite markers; high-throughput capillary electrophoresis; sequencing; ITS region of 45S rDNA (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
http://linked.open...inujicichPrijemcu
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
http://linked.open.../prideleniPodpory
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
http://linked.open...atUdajeProjZameru
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
http://linked.open...tniCyklusProjektu
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
  • genetic diversity
  • genome size
  • ploidy level
  • sequencing
  • gene bank
  • high-throughput capillary electrophoresis
  • microsatellite markers
  • Musaceae
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of
Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024


Alternative Linked Data Documents: ODE     Content Formats:   [cxml] [csv]     RDF   [text] [turtle] [ld+json] [rdf+json] [rdf+xml]     ODATA   [atom+xml] [odata+json]     Microdata   [microdata+json] [html]    About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data] Valid XHTML + RDFa
OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 41 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software