About: Three-dimensional analysis of endoplasmic reticulum structure based on processing of images captured by 2-photon and confocal microscopy

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Three-dimensional analysis of endoplasmic reticulum structure based on processing of images captured by 2-photon and confocal microscopy Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB6011309
Description	We will test the applicability and efficiency of methods for estimating the length of ER tubules, their length density in cell, proportion of lamellar sheets in ER, mean size and size distribution of meshes in the ER net, characteristics of ER organization, anisotropy and texture. The quantitative evaluation of such characteristics together with ER three-dimensional reconstruction and visualization will provide a complex and objective information about its structure and thus will help in studies of ER changes, both in normally developing cells and cells suffering from various types of stress. The methods will be tested on GFP-transformed tobacco cells (line BY-2). The ER characteristics wil estimated by contemporary unbiased stereological methods and image analysis techniques applied to three-dimensional image data acquired by 2-photon and confocal microscopy. (en) Budeme testovat použitelnost a účinnost metod pro měření délky tubulů endoplazmatického retikula (ER), jejich délkové hustoty v buňce, podílu lamelárních struktur v ER, průměrné velikosti a rozdělení velikostí ok v ER síti, charakteristik organizace, anizotropie a textury ER. Kvantitativní vyhodnocení těchto charakteristik spolu s trojrozměrnými rekonstrukcemi ER poskytne komplexní a objektivní informace o struktuře ER, což přispěje k podrobnějšímu studiu jeho změn jak v normálně se vyvíjejících buňkách, tak i v buňkách vystavených různým typům stresu. Tyto metody budou testovány na tabákových buňkách linie BY-2 transformovaných genem pro GFP. Charakteristiky ER budou odhadovány současnými stereologickými metodami a technikami analýzy obrazu aplikovanými na trojrozměrná obrazová data získaná 2-fotonovou a konfokální mikroskopií.
Title	Three-dimensional analysis of endoplasmic reticulum structure based on processing of images captured by 2-photon and confocal microscopy (en) Trojrozměrná analýza struktury endoplazmatického retikula na základě zpracování obrazů z 2-fotonového a konfokálního mikroskopu
skos:notation	KJB6011309
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB6011309/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB6011309/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-02-12 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33615648
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EA - Morfologické obory a cytologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	endoplasmic tericulum; 3-D analysis; 2-photopn microscopy; confocal microscopy; image analysis; quantiative evaluation; GFP-transformed tobacco cells; stereological methods (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Fyziologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	2 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	13 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	13 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02003-XJ
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	JC - Počítačový hardware a software EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Image analysis methods for measuring the length density of endoplasmic reticulum (ER) tubules in tobacco cells were developed and implemented. Changes in ER structure were found during early phases of toxic influence of Al ions and latrunculin B. (en) Byly vyvinuty a implementovány metody analýzy obrazu pro měření délkové hustoty tubulů endoplazmatického retikula (ER) tabákových buněk. Bylo zjištěno, že v časných fázích toxického působení Al iontů a Latrunkulinu B dochází ke změnám struktury ER. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	confocal microscopy image analysis 2-photopn microscopy 3-D analysis GFP-transformed tobacco cells quantiative evaluation endoplasmic tericulum
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2003/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2003/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2004/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2004/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2005/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2005/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2006/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2006/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2007/ico%3A67985823 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6011309/2007/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software