About: Population structure and species delimitation within the Trapeliopsis glaucolepidea agg. based on multigene DNA-sequence data

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Population structure and species delimitation within the Trapeliopsis glaucolepidea agg. based on multigene DNA-sequence data Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB6005306
Description	The lichen Trapeliopsis glaucolepidea occurs in C and NW Europe and in highlands of central and S America and E Africa. The morphological variation of the species is extremely large and it is difficult to assess whether this variation is due to environmental factors or fixed genetical traits. A molecular analysis of variable sequences from 3 different nuclear and mitochondrial loci (ITS, IGS rDNA, mtLSU) shall be performed on a large sample of thalli covering more or less the complete distributional area of the lichen. Mutual comparison of sequences within and among known areas should inform whether some populations already constitute diverged lineages assignable to species of if gene flow persists. The above mentioned spacers and genes are potentially highly variable. After appropriate evaluation of the dataset, i.e. establishing the distribution pattern of single haplotypes, the history of the evolutionary processes within the group shall be assessed. (en) Trapeliopsis glaucolepidea je lišejník vyskytující se kromě stř. a SZ Evropy také v horách tropické části střední a Jižní Ameriky a vých. Afriky. Variabilita druhu je velká a je velmi obtížné na základě kvantitativních rozdílů hovořit, zda-li se jedná pouze o fenotypický projev vyvolaný vlivem prostředí nebo zdali jsou změny geneticky fixované. Molekulární analýza relativně variabilních úseků sekvencí 3 různých loků 2 genomů (ITS a IGS rDNA, mtLSU) na rozsáhlém souboru vzorků zahrnujících víceméně rovnoměrně celý areál druhu by měla po vzájemném srovnání v rámci a mezi vytyčenými arelami přinést informace o tom, zda-li některé populace již tvoří oddělené linie a jedná se již o druhy nebo zda-li probíhá i nadále k genovému toku. Uvedené spacery a geny mají poměrně velký potenciál variability a bude tudíž možné po náležitém zpracování sekvencí zhodnotit na základě distribuce jednotlivých haplotypů průběh evolučních procesů v této skupině.
Title	Population structure and species delimitation within the Trapeliopsis glaucolepidea agg. based on multigene DNA-sequence data (en) Populační struktura a odlišení druhu v rámci Trapeliopsis glaucolepidea agg. založené na multigenovém přístupu DNA-sekvencí
skos:notation	KJB6005306
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB6005306/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB6005306/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-02-12 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33614908
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EF - Botanika
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	lichenized fungi; phylogeography; speciation; population genetics; IGS; ITS; mt LSU; Trapeliopsis glaucolepidea; DNA sequences (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Botanický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02003-XJ
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Tpsis glaucolepidea agg. is a variable but monophyletic group composed of genetically closely related lineages, some perhaps forming microspecies. DNA data indicate contiguous range expansion/fragmentation rather than an accidental historical event (en) Tpsis glaucolepidea agg. je variabilní, přesto monofyletická skupina tvořená z geneticky blízce příbuzných linií, možná mikrospecií. DNA data indikují spíše souvislé rozšiřování/fragmentaci areálu nežli náhodnou historickou událost (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	lichenized fungi IGS ITS phylogeography population genetics speciation Trapeliopsis glaucolepidea mt LSU
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6005306/2003/ico%3A67985939 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6005306/2004/ico%3A67985939 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6005306/2005/ico%3A67985939 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB6005306/2006/ico%3A67985939

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software