About: Biosynthesis of asukamycin polyketide chains: Prospects for hybrid antibotics

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Biosynthesis of asukamycin polyketide chains: Prospects for hybrid antibotics Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB5020306
Description	Manumycin-type antibiotics, produced by some streptomycete strains, are mainly studied for their putative anticancer and antiinflammatory effects. The metabolites typically consist of two cyclic carbon unitslinked by two polyketide chains. Their biosynthetic pathway has already been proposed based on the experiments with radioactive precursors. However, the genes, encoding the pathways components, have not been studied yet. The project aim is, first, to map the gene cluster responsible for the asukamycin biosynthesis (on the basis of its partial knowledge) and to compare its structure with that of manumycin gene cluster, focusing on thebiosynthesis of polyketide chain moieties. Based on the results, second, to test the prospects of the directed biosynthesis of new hybrid asukamycin derivatives with the help of gene manipulation of the genes encoding relevant polyketide synthases of both producers, Streptomyces parvulus and Streptomyces nodosus var. asukaensis. (en) Manumycinová antibiotika, produkovaná některými kmeny streptomycet, jsou studována především pro wvé potenciální protinádorové a protizánětlivé účinky. Tyto metabolity jsou charakteristické přitomností dvou cyklických uhlíkových jednotek spojených dvěma polyketidovými řetězci. Jejich biosyntetická dráha byla již navržena na základě experimentů s radioaktivně značenými prekurzory. Geny, které ji kódují, však zatím příliš studovány nebyly. Cílem této práce by v prvé řadě mělo být vymezení genového shluku zodpovědného za biosyntézu asukamycinu (na základě jeho částečné znalosti) a jeho porovnání s manumycinovým genovým shlukem, a to se zaměřením na biosyntézu polyketidových řetězců. V návaznosti na získané výsledky pak otestování možností řízené biosyntézy nových hybridních asukamycinových derivátů pomocí genových manipulací s geny kódujícími příslušné polyketidsyntasy u obou produkčních mikroorganismů, Streptomyces parvulus a Streptomyces nodosus var. asukaensis.
Title	Biosynthesis of asukamycin polyketide chains: Prospects for hybrid antibotics (en) Biosyntéza polyketidových řetězců asukamycinu: Možnosti tvorby hybridních antibiotik
skos:notation	KJB5020306
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB5020306/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB5020306/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-02-12 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33613942
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EE - Mikrobiologie, virologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	biosynthesis of the manumycin-type antibiotics; streptomycetes; asukamycin; polyketide synthases; hybrid antibiotics (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	1 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2003
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02003-XJ
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CE - Biochemie EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...jektu+dodavatelem	The results include identification and sequencing of the manumycin gene cluster in S. parvulus Tű64. Based on the comparison with the asukamycin genes, the polyketide chain synthesis model was created and constructs for its verification were prepared. (en) Výsledkem je identifikace a sekvenace shluku genů pro biosyntézu antibiotika manumycinu ze S. parvulus Tű64. Porovnáním s geny asukamycinového shluku byl vytvořen model syntesy polyketidových řetězců a připraveny konstrukty pro jeho ověření. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	asukamycin polyketide synthases streptomycetes biosynthesis of the manumycin-type antibiotics
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB5020306/2003/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB5020306/2004/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB5020306/2005/ico%3A61388971 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB5020306/2006/ico%3A61388971

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 112 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software