About: Radiolytic damage of DNA bases

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Radiolytic damage of DNA bases Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB4048401
Description	Oxidative damage of DNA bases belongs to the most severe DNA damages caused by ionizing radiation. Presented project is aimed to the theoretical predictions of the yields of reactions of radiolytic species (OH, H, eaq-) with individual nucleobases, nucleosides and short DNA oligomers. The diffusion of radicals produced by water radiolysis will be simulated by Monte Carlo technique, radical reactions with particular atoms of bases and deoxyribose will be calculated according to Smoluchowski theory. Probabilities of reactions with particular sites within nucleobases, nucleosides, and DNA oligonucleotides will be compared to available experimetally determined yields of base damages caused by ionizing radiation or other chemical oxidative agents. The goal of the work is to establish differences in reactivity of free DNA bases and bases within double stranded DNA. The effect of surrounding base sequence and DNA dynamics will be taken into account. (en) Poškození bází DNA patří mezi nejzávažnější poškození DNA účinkem ionizujícího záření. Projekt je zaměřen na teoretické simulace reakcí produktů radiolýzy (OH, H, eaq-) s jednotlivými bázemi, nukleosidy a krátkými fragmenty DNA. Difúze radikálů vzniklých radiolýzou prostředí bude simulována metodou Monte Carlo, reakce radikálů s jednotlivými atomy bází a deoxyribózy budou modelovány podle teorie Smoluchowského. Pravděpodobnosti reakcí radikálů s jednotlivými bázemi, nukleosidy, a oligonukleotidy DNA budou porovnány s dostupnými výtěžky modifikovaných bází vystavených účinkům ionizujícího záření nebo jiným oxidačním činidlům. Cílem práce je určit rozdíl v reaktivitě bází DNA vyskytujících se samostatně a nebo v makromolekule DNA. Bude také stanoven vliv okolních bází a dynamiky dvoušroubovice DNA.
Title	Radiolytic damage of DNA bases (en) Poškození bází DNA produkty radiolýzy vody
skos:notation	KJB4048401
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB4048401/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB4048401/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2014-02-12 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33615840
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CE - Biochemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	DNA bases; radical attack; hydroxyl radical; ionizing radiation; theoretical modeling (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav jaderné fyziky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	6 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2004
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02004-J
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	BO - Biofyzika
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Pravděpodobnosti reakcí OH? radikálů s atomy bází získané teoretickými výpočty byly porovnávány s experimentálními výtěžky radiolytických poškození bází. Byl určen rozdíl v reaktivitě jednotlivých atomů a celých bází samostatně a v makromolekule DNA (cs) Probabilities of OH? radical reaction with base atoms obtained by theoretical calculations were compared to exper. yields of radiolytically damaged bases. The reactivity of particular atoms and the whole individual bases and within DNA were determined. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	DNA bases hydroxyl radical ionizing radiation radical attack
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB4048401/2004/ico%3A61389005 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB4048401/2005/ico%3A61389005 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB4048401/2006/ico%3A61389005

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software