About: Molecular Dynamics Simulations of Annealed Polyelectrolytes

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Molecular Dynamics Simulations of Annealed Polyelectrolytes Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=KJB401110701
Description	The aim of the project is to study weak polyelectrolytes (PEs) using molecular dynamics (MD) simulations. Weak PEs have peculiar properties and many applications in industry and technology. They are an essential part of biological systems, since most proteins are weak PEs. Unlike strong PEs, the weak ones are capable of reversible dissociation and hence the charges on them are mobile. Current MD methods do not provide a tool for simulating weak PEs because the mobility of charges is a complication which has not been overcome yet. Within our project a simple phenomenological model will be developed which will account for the mobility of charges in weak PEs. Next the effect of the mobility of charges on the properties of the PE will be studied. Later the dissociation will be treated in a more sophisticated manner and simulations using the more sophisticated model will be performed. Thus for the first time the essential characteristics of weak PEs will be accounted for in an MD simulation (en) Cílem projektu je studium slabých polyelektrolytů (PE) pomocí molekulové dynamiky (MD). Slabé PE mají specifické vlastnosti a mnoho aplikací v průmyslu a technologii. Jsou také nedílnou součástí biologických systémů, protože mezi ně patří většina proteinů. Na rozdíl od silných PE, slabé PE jsou schopny reverzibilní disociace, což způsobuje pohyblivost nábojů na polymerním řetězci. Současné metody MD neobsahují nástroj na simulaci slabých PE, protože pohyblivost nábojů je komplikace, která zatím nebyla vyřešena. V rámci našeho projektu chceme vyvinout jednoduchý fenomenologický model, který zahrne pohyblivost nábojů na řetězcích slabých PE. Dále budeme studovat vliv pohyblivosti nábojů na vlastnosti slabých PE. Později vytvoříme sofistikovanější model disociace a vykonáme simulace pomocí tohoto modelu. Tímto způsobem budou poprvé v MD simulaci zahrnuty specifické vlastnosti slabých PE.
Title	Molecular Dynamics Simulations of Annealed Polyelectrolytes (en) Počítačové simulace slabých polyelektrolytů pomocí molekulové dynamiky
skos:notation	KJB401110701
http://linked.open...avai/cep/aktivita	The research grant projects for juniors
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB401110701/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/KJB401110701/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2011-06-14 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	65949704
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	CD - Makromolekulární chemie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	polyelectrolytes; simulation; molecular dynamics; weak polyelectrolytes; SCF; Monte Carlo; rate of dissociation; chain transfer (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Přírodovědecká fakulta
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...lneniVMinulemRoce	2009-04-28 (xsd:date)
http://linked.open.../prideleniPodpory	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/prideleniPodpory/KJB401110701
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2009
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2010
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02007-B
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...ep/ukonceniReseni	2009-12-31 (xsd:date)
http://linked.open.../cep/vedlejsiObor	CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
http://linked.open...ep/zahajeniReseni	2007-01-01 (xsd:date)
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Publikován jeden článek s výsledky simulací; druhý je v připravě. Jeden související článek přijat k publikaci. Odeslány jeden přehledový článek zčásti obsahující výsledky projektu a jeden úzce související článek. Další dva související články v přípravě. (cs) Published one paper with results of MD simulations; another one in preparation. One related paper accepted. One review paper containing partly results from the project and another closely related paper submitted. Two other related papers in preparation. (en)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	polyelectrolytes Monte Carlo molecular dynamics simulation SCF rate of dissociation weak polyelectrolytes
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB401110701/2007/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB401110701/2008/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB401110701/2009/orjk%3A11310 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/KJB401110701/2010/orjk%3A11310

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software