Attributes | Values |
---|
rdf:type
| |
rdfs:seeAlso
| |
Description
| - Unnatural nucleobases incorporated into DNA molecules are the basis of the expanded genetic alphabet, which opens the way to a variety of biotechnology applications. Using the methods of theoretical chemistry, we will study the role various structural and environmental effects play in the stabilization of oligonucleotide duplexes containing unnatural nucleobases and in the selectivity of the respective pairing schemes. We will elaborate and apply highly reliable computational protocols for the description of both the intrinsic and external influences leading to the formation of stable and selective unnatural nucleobase-containing motifs. The intrinsic and external factors will be characterized by ab initio quantum chemical methods and classical molecular dynamics, respectively. Based on computational data, the theory of significant prediction value will be developed which combines these contributions and thus enables to quantify the stability and selectivity of novel DNA skeletons. (en)
- Nepřirozené báze zabudované do molekul DNA tvoří základ rozšířené genetické abecedy, jež otvírá cestu k mnohým biotechnologickým aplikacím. Pomocí metod teoretické chemie prostudujeme roli různých strukturních a vnějších efektů rozhodujících pro stabilizaci dvoušroubovic DNA obsahujících nepřirozené báze a pro selektivitu vazebných schémat, jež se v nich vyskytují. Vypracujeme vysoce spolehlivé výpočetní postupy pro popis jak vnitřních, tak vnějších vlivů vedoucích k tvorbě stabilních a selektivních strukturních motivů obsahujících nepřirozené báze; tyto postupy upotřebíme během rozsáhlých výpočtů. Vnitřní vlivy budou studovány ab initio kvantově chemickými metodami, kdežto vliv okolí bude popsán pomocí klasické molekulové dynamiky s explicitním zahrnutím molekul rozpouštědla a protiiontů. Na základě vypočtených dat bude vyvinuta teorie s významnou predikční schopností, jež společně popisuje tyto vlivy a tím umožňuje kvantifikovat stabilitu a selektivitu neobvyklých fragmentů v DNA.
|
Title
| - The Theory of Stability and Selectivity of Unnatural DNA Nucleobases (en)
- Teorie stability a selektivity nepřirozených bází DNA
|
skos:notation
| |
http://linked.open...avai/cep/aktivita
| |
http://linked.open...kovaStatniPodpora
| |
http://linked.open...ep/celkoveNaklady
| |
http://linked.open...datumDodatniDoRIV
| |
http://linked.open...i/cep/druhSouteze
| |
http://linked.open...ep/duvernostUdaju
| |
http://linked.open.../cep/fazeProjektu
| |
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor
| |
http://linked.open...hodnoceniProjektu
| |
http://linked.open...vai/cep/kategorie
| |
http://linked.open.../cep/klicovaSlova
| - DNA; unnatural nucleobases; stability; selectivity; nonbonding interactions; ab initio quantum chemical methods; molecular dynamics; hydrophobic effect (en)
|
http://linked.open...ep/partnetrHlavni
| |
http://linked.open...inujicichPrijemcu
| |
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu
| |
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu
| |
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV
| |
http://linked.open...enychVysledkuVRIV
| |
http://linked.open...lneniVMinulemRoce
| |
http://linked.open.../prideleniPodpory
| |
http://linked.open...iciPoslednihoRoku
| |
http://linked.open...atUdajeProjZameru
| |
http://linked.open.../vavai/cep/soutez
| |
http://linked.open...usZobrazovaneFaze
| |
http://linked.open...ai/cep/typPojektu
| |
http://linked.open...ep/ukonceniReseni
| |
http://linked.open...ep/zahajeniReseni
| |
http://linked.open...jektu+dodavatelem
| - While some partial succes of the project has been reached, the results of the project have not been published adequately. (en)
- Přestože se povedlo dosáhnout dílčích úspěchů projektu, nebyly výsledky dosud adekvátním způsobem publikovány. (cs)
|
http://linked.open...tniCyklusProjektu
| |
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo
| - DNA
- molecular dynamics
- selectivity
- stability
- ab initio quantum chemical methods
- nonbonding interactions
- unnatural nucleobases
|
is http://linked.open...vavai/cep/projekt
of | |