About: Inducible DNA repair in Arabidopsis thaliana

Facets (new session)
Description
Metadata
Settings
- owl:sameAs
- Inference Rule:

About: Inducible DNA repair in Arabidopsis thaliana Goto Sponge NotDistinct Permalink

An Entity of Type : http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt, within Data Space : linked.opendata.cz associated with source document(s)

Attributes	Values
rdf:type	http://linked.opendata.cz/ontology/domain/vavai/Projekt
rdfs:seeAlso	http://www.isvav.cz/projectDetail.do?rowId=IAA6038201
Description	Plants protect integrity of their DNA against genotoxic factors by efficient DNA repair. Recently we have shown that the phenomenon of clastogenic (chromosome damage) adaptation to mutagenic treatment depends on thebaseexcision DNA repair. In this pathway are involved polymeraxe beta (Polbeta) and poly(ADP-ribose) polymerace (PARP) that might be also involved in decision mechanism of programmed cell death. We proposed to take advantage of commercial availability to screen T-DNA tagged Arabidopsis lines for possible knockouts in Polbeta and PARP genes by PCR, because their size quaranties at least 80 % chance of positive hit. Knockout lines will be characterized and tested for changes in sensitivity do DNA damage under various adaptation schedules and by comet assay for the ability to repair DNA damage or induce programmed cell death. We want to answer the question whether these genes preserve the same key roles in DNA repair or whether plants have alternate mechanism. (en) Rostliny brání integritu DNA proti genotoxickému působení účinnou reparací. Před nedávnem bylo prokázáno, že za jevem adaptace k poškození chromosomů mutageny odpovídá excizní reparace poškozených bazí DNA. Součástí této reparační dráhy je i polymerasa beta (Pol beta) a poly(ADP-ribose) polymerasa (PARP), která je i součástí rozhodovacího mechanismu spouštění apoptosy. V navrhovaném projektu chceme využít komerčně dostupné možnosti vyhledat pomocí PCR linie Arabidopsis s inserčně mutovanými geny Pol beta a PARP, protože jejich velikost zajišťuje přinejmenším 80 % pravděpodobnost, že mutace nastala v kódující oblasti. Linie budou charakterizovány a bude u nich testována citlivost k poškození DNA při různých režimech adaptace. metodou komet bude zjišťována schopnost reparovat poškození DNA nebo indukovat apoptosu. Těmito pokusy chceme zodpovědět otázku, zda si tyto pro jiné organismy klíčové geny zachovávají stejnou úlohu a nebo zda rozsliny mají alternativní způsob opravy poškozené DNA.
Title	Inducible DNA repair in Arabidopsis thaliana (en) Studium indukované reparace DNA u Arabidopsis thaliana
skos:notation	IAA6038201
http://linked.open...avai/cep/aktivita	Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
http://linked.open...kovaStatniPodpora	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA6038201/celkovaStatniPodpora
http://linked.open...ep/celkoveNaklady	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/projekt/IAA6038201/celkoveNaklady
http://linked.open...datumDodatniDoRIV	2007-09-26 (xsd:date)
http://linked.open...i/cep/druhSouteze	VS - Veřejná soutěž ve výzkumu a vývoji
http://linked.open...ep/duvernostUdaju	S - Úplné a pravdivé údaje nepodléhající ochraně podle zvláštních právních předpisů
http://linked.open.../cep/fazeProjektu	33614718
http://linked.open...ai/cep/hlavniObor	EB - Genetika a molekulární biologie
http://linked.open...hodnoceniProjektu	U - Uspěl podle zadání, tj. byly splněny cíle a jeho předpokládané výsledky uvedené ve smlouvě / rozhodnutí o poskytnutí podpory
http://linked.open...vai/cep/kategorie	ZV - Základní výzkum
http://linked.open.../cep/klicovaSlova	Base excision DNA repair; Programmed cell diath; Genes; PCR Screen; Arabidopsis T-DNA knockout lines (en)
http://linked.open...ep/partnetrHlavni	Ústav experimentální botaniky AV ČR, v.v.i.
http://linked.open...inujicichPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open...cep/pocetPrijemcu	1 (xsd:int)
http://linked.open...ocetSpoluPrijemcu	0 (xsd:int)
http://linked.open.../pocetVysledkuRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...enychVysledkuVRIV	4 (xsd:int)
http://linked.open...okUkonceniPodpory	2005
http://linked.open...okZahajeniPodpory	2002
http://linked.open...iciPoslednihoRoku	2006
http://linked.open...atUdajeProjZameru	2006
http://linked.open.../vavai/cep/soutez	SAV02002-AB
http://linked.open...usZobrazovaneFaze	DUU
http://linked.open...ai/cep/typPojektu	P - Projekt výzkumu a vývoje financovaný ze státního rozpočtu
http://linked.open...jektu+dodavatelem	Thirteen Arabidopsis knockout mutants in various repair pathways demonstrated that nearly instant sealing of double strand breaks is the most effective and efficient repair pathway independent on mutation and tissue studied. (en) Studiem 13 knockoutových mutant Arabidopsis v různých reparačních drahách bylo ukázáno, že přednostní a nejúčinější drahou, nezávislou na studovaných mutacích ani tkáni je téměř okamžitá reparace dvojvláknových zlomů DNA. (cs)
http://linked.open...tniCyklusProjektu	ZBBKU
http://linked.open.../cep/klicoveSlovo	Genes PCR Screen Programmed cell diath Base excision DNA repair
is http://linked.open...vavai/cep/projekt of	http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038201/2002/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038201/2003/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038201/2004/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038201/2005/ico%3A61389030 http://linked.opendata.cz/resource/domain/vavai/cep/ucast/IAA6038201/2006/ico%3A61389030

Faceted Search & Find service v1.16.118 as of Jun 21 2024

Alternative Linked Data Documents: ODE Content Formats:

RDF

ODATA

Microdata

About

OpenLink Virtuoso version 07.20.3240 as of Jun 21 2024, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (126 GB total memory, 58 GB memory in use)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software