Description
| - This project proposes a novel and powerful approach for the efficient analysis and mapping of large eukaryotic genomes. Specifically, we propose the development of means for the construction of chromosome-specific DNA libraries, isolation of chromosome-specific DNA sequences and markers, and the development of chromosome paints for economically important cereals (Zea mays, Secale cereale, Hordeum vulgare and Triticum aestivum), legumes (Vicia faba, Pisum sativum, Medicago sativa), a coniferous tree (Picea abies), and a dioecious plant Melandrium album. The project is based on a multidisciplinary approach combining classical genetics (the use of isogenic and translocation lines) with flow cytogenetics (chromosome isolation and flow-sorting of single chromosome types), molecular techniques (DNA isolation, cloning and primed in situ DNA labelling). The ultimate goal will be to use chromosome-specific libraries, markers and paints to increase the density and accuracy of genetics (en)
- Projekt je zaměřen na strukturní analýzu a mapování genomů vyšších rostlin novými a účinnějšími metodickými postupy. Budou vyvinuty nebo zdokonaleny techniky pro konstrukci chromozómově specifických knihoven DNA, cílenou izolaci markerů z vybraných oblastí genomu a přípravu komplexních sond pro celé chromozómy, a to u ekonomicky významných druhů obilovin (Zea mays, Secale cereale, Hordeum vulgare and Triticum aestivum), leguminóz (Vicia faba, Pisum sativum, Medicago sativa), smrku ztepilého (Picea abies) a knotovky bílé (Melandrium album). Projekt je založen na mezioborovém přístupu, kombinujícím klasickou genetiku a cytogenetiku s průtokovou cytometrií (izolace chromozómů a separace jejich jednotlivých typů), molekulárními technikami (izolace, klonování a sekvenování DNA) a molekulární cytogenetikou (in situ hybridizace a chromosome painting). Konečným cílem je využití chromozómově specifických knihoven, markerů a komplexních sond pro zahuštění a zpřesnění genetických map, izolaci a lokalizaci
|